| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,344,255 | G→A | R296H (CGC→CAC) | melB → | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,344,255 | 0 | G | A | 100.0% | 33.1 / NA | 14 | R296H (CGC→CAC) | melB | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (6/8); total (6/8) | |||||||||||
CCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTG > NC_000913/4344016‑4344448 | ccATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGAGCTAATTTATACACACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGACTCTTGCTTATAATGTCGCCCGCAACATTATTACCGGCTTTACTATCTATTCTTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGAGACGTTAGAATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATggg > 1:50247/1‑251 (MQ=255) acacTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCGTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTTGTATGCGGGAGCTGCGAACCTGGTGACGTTAGTATGCTGCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGCCACATTTTATGGGCCGGAGc < 1:127624/251‑1 (MQ=255) cGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTGGTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTAGTATCTGGCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCg < 1:331034/250‑1 (MQ=255) gTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGCTGACGCGGATTTCTTCCCCTCTTATCTGTCGTCTCCGGGCACTGCTACCCTGCTGACGTCCGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCAGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTTTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATtgt > 1:226206/1‑251 (MQ=255) cAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATGTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTGCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGAttn < 1:36542/251‑2 (MQ=255) ntttGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGCGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTCATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAAtg > 1:27779/2‑251 (MQ=255) gCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCTGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTTACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTTTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTggg < 1:213593/251‑1 (MQ=255) cATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATGTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGTGGTTAAGCGTTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACATCGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCt < 1:324650/249‑1 (MQ=255) gATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATGATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGTGCTATCACAAc < 1:256747/180‑1 (MQ=255) ccTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCACACGCTTAGTTAAATCATTATCGCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCATCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGATTTTCTGGGTATTAc > 1:165155/1‑228 (MQ=255) cGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAACTCTTTACCCAGACACCTTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACACCGTCGTCCTCATTGTGCTTGCGGGTATTTTGCTGACTGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAatat > 1:181935/1‑251 (MQ=255) ggTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAAGCATTATCCCTACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATGCTTCCGGTGTTAAGCTGTTGTGTGCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAAc < 1:285651/130‑1 (MQ=255) ngTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTg > 1:196938/2‑236 (MQ=255) aTTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACACATTTTATGGGCCGGAGCAGCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCGCATTGGGAttn < 1:261683/137‑2 (MQ=255) | CCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTG > NC_000913/4344016‑4344448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |