| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,521,516 | C→T | G153R (GGA→AGA) | hofN ← | DNA utilization protein HofN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,521,516 | 0 | C | T | 100.0% | 39.6 / NA | 19 | G153R (GGA→AGA) | hofN | DNA utilization protein HofN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (7/12); total (7/12) | |||||||||||
CCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCCCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCGGGTAAATTGTCGCTGGCGCTGCCGTTGCGAACGCTGTTCG > NC_000913/3521306‑3521736 | ccggaGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGAtt > 1:25953/5‑220 (MQ=255) cATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGc < 1:183310/250‑1 (MQ=255) gTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGCAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTc > 1:122090/1‑251 (MQ=255) aacATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCctgct < 1:306526/251‑1 (MQ=255) nngCNNNNNGAANGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTTATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCTCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGc < 2:206013/144‑1 (MQ=255) naGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCACTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGc > 1:206013/2‑146 (MQ=255) gAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACCTGTTCATCGCTCACCTTCCTTGTTAACTGATACTCACATTGCCCGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGAGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGtt > 1:136522/1‑251 (MQ=255) cAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCAGCAGTCAAAGAACATGTTCAGCGCTAACCTTCCTTGTTAACTTATACTCAAATTGCGAGCGTCCCTGCGCGTCCGACTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAg < 1:210648/159‑1 (MQ=255) cttccttGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGGCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTTCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATcn < 1:85629/88‑2 (MQ=255) gTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATACTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATg < 1:73405/120‑1 (MQ=255) gTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGNCCCTGCNNATNCTGCTGCGTGGCTCTCCGCNGANNNANNNGNACAGANGCNNCCTGGCGGANTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATg > 2:73405/1‑120 (MQ=255) tAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGTCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCGGGTAAATTGTCGCTGgcgc < 1:273122/250‑1 (MQ=255) tAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCATCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCTGGTAAATTGTCTCTGgcgc < 1:272737/250‑1 (MQ=255) aGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCGGGTAAATTGTCGCTGGCGCTGCCGTTGCGAACGCTGTTcg < 1:275252/251‑1 (MQ=255) gTCCCTGCGCATCCTGCAGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGGATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAAAGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTCCCAGCTTATCGTTGTCCGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCGGGTAAATTGTCGCTGGCGCTGCCGTTgagacagct > 1:182232/1‑235 (MQ=255) cccTGCGCATCCTGCGGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGTGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGAtc < 1:145443/114‑1 (MQ=255) ccTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGAGCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCGCGGGTAAAAGcgccgc < 1:21732/175‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTcn < 1:29555/152‑2 (MQ=255) ccTGCTGCGTGGCTCTCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTNGTCNNNNNggnn > 2:201549/1‑144 (MQ=255) | CCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAACCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCCCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGTGCTTCCAGCGCAGATTGCCAGTCGCGGGTAAATTGTCGCTGGCGCTGCCGTTGCGAACGCTGTTCG > NC_000913/3521306‑3521736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |