| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,500,603 | C→T | L232L (CTG→TTG) | frlA → | fructoselysine/psicoselysine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,500,603 | 0 | C | T | 84.6% | 25.8 / ‑5.6 | 14 | L232L (CTG→TTG) | frlA | fructoselysine/psicoselysine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (5/6); minor base A (2/0); total (7/7) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCTAATTACCATCGCCAAAATTATCCCGTTCACTATCGTCATTGGCCTTGGGATCTTCTGGTTTAAAGCGGAGAATTTTGCCGCCCCTACCACCACTGCGATTGGCGCAACGGGCAGCTTTATGGCGCTGCTGGCGGGGATCTCTGCCACCAGTTGGTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGCTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTCCGACGCCCTGACCTGGATCCCCGCACTCGGCAGCACCGCTGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGTCATTCTTGGTTCGCTTTCCAGCTGCGTGATGTACCAGCCGCGGCTGGAATAC > NC_000913/3500370‑3500833 | cGCTAATTACCATCGCCACAATTATCCCGTTCACTATCGTCATTGGCCTTGGGATCTTCTGGTTTAAAGCGGAGAATTATGCCGCCCCTACCACCACTGCGATTGGCGCAACGGGCAGCTTTATGGCGCTGCTGGTGGGGATCTCTGCCACCAGTTGGTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTctg > 1:73539/1‑251 (MQ=255) ttCACTATCGTCATTGGCCTTGGGATCTTCTGGTTTAAAGCGGAGAATTTTGCCGCCACTACCACCACTGCGATTGGCGCAAAGGGCAGCTTTATGGCGCTGGTGGGGGGGATCTCTGCCACCAGTTGGACGTATACCGGCATGGCCTATATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGgc > 1:168052/1‑251 (MQ=255) accacTGCGATTGCCGCAACGGGAAGCTTTATGGCGCTGCTAGTGGGGATCCCTGCCACCAGTTTGTCGTATAACAGCATGGCCACTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAACAACCCCGGAAAAACAATGTCACGAGCGATGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCATGTTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTCCgc > 1:211578/1‑250 (MQ=255) tATGGCGCTGCTGGTGGGGATCTCTGCCACCAGTTGGTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGGTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTCCGACGCCCTGACCTGGATCCCCGCACTCGgc < 1:261089/250‑1 (MQ=255) caccaGTTGGTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTgg < 1:250423/131‑1 (MQ=255) ngTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTcc > 1:197863/2‑185 (MQ=255) ngcnaTGNCNNCNNTCGNTTATAGGACCGGCGAAATTAANNACCCCGGAANCACCATGCCACGTGCGGTGATTGGTTCCTTTCTGCTGGTTCTGGTTCTCTACTNCCTGCTGGCNNGGNTGATTNCNNNCNNNATNCGCCTCGACAAACTCGCCANTTNNGAGGCGNCGATTTCCGACGCCCTGCCCTGGagc < 2:73539/189‑3 (MQ=255) cTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCCTGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGGTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTgg > 1:25479/1‑104 (MQ=255) anntGACCGNNGAAATTACATACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTCGTTCTGGTGCTCTCCACCCTGCTGGCGCTgg < 2:25479/99‑1 (MQ=255) gACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGCGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGACCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCAGATTTCCGACGCCCTGACCTGGATCCCCGCACTCGGCAGCACCGCTGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGTCATTCTTGGTTCGCTTTCCAGCTGCGTg > 1:43268/1‑250 (MQ=255) gANNNNNAAANCCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTcc < 2:197863/144‑1 (MQ=255) aaTTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGATGATTAGTTCCTGTATCCTGACTCCGGTGCTCTCCACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCAATTCGACAAACTCGCCAATACTGCAACGCCGATTTCCGACACCCTGACCTGGATCCCCGCACCCGGCAGCACCGCTGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGTCATTATTGGTTCGCTTTCCAGCTGCGTGATGTACCAGc > 1:173402/1‑251 (MQ=255) ccccGGAAAAACCATGCCACGAGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACGCGCCAATTCGGAAACGCCGATTTCCGACGCCCTGCCCGGGATCCCCGCACTCGGCAGCACCGCGGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGTCATTCTGGGTTCGCTTTCCAGCTGCGTGATTTACCAGCCGCGGCTgg < 1:183762/251‑1 (MQ=255) gataacattacgacaaaGCGTTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAAGTCTGAAACGCCGATTTCCGACGCCCTGACCTGGATCCCCGCACTCGGCGGTACCGCGGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGGCAGTCTTGGTTCGCTTTCCAGCTGCTTGATGTACCAGCCGCGGCTGGAATAc < 1:157487/235‑1 (MQ=255) | CGCTAATTACCATCGCCAAAATTATCCCGTTCACTATCGTCATTGGCCTTGGGATCTTCTGGTTTAAAGCGGAGAATTTTGCCGCCCCTACCACCACTGCGATTGGCGCAACGGGCAGCTTTATGGCGCTGCTGGCGGGGATCTCTGCCACCAGTTGGTCGTATACCGGCATGGCCTCTATCTGTTATATGACCGGCGAAATTAAAAACCCCGGAAAAACCATGCCACGAGCGCTGATTGGTTCCTGTCTGCTGGTTCTGGTGCTCTACACCCTGCTGGCGCTGGTGATTTCCGGCCTGATGCCCTTCGACAAACTCGCCAATTCTGAAACGCCGATTTCCGACGCCCTGACCTGGATCCCCGCACTCGGCAGCACCGCTGGGATCTTTGTTGCCATCACGGCGATGATCGTCATTCTTGGTTCGCTTTCCAGCTGCGTGATGTACCAGCCGCGGCTGGAATAC > NC_000913/3500370‑3500833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |