| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,436,817 | C→T | R100R (CGC→CGT) | trkA → | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,436,817 | 0 | C | T | 100.0% | 42.1 / NA | 17 | R100R (CGC→CGT) | trkA | NAD‑binding component of Trk potassium transporters |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (9/8); total (9/8) | |||||||||||
CCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCG > NC_000913/3436609‑3437043 | ccAACGGCGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCCGGGGCATGGCTGTCATCAACGCGTATTGAGGGTGGCAGGTGCCGCCGACGCCGCTATGCTGGTTGATGTAACCAGTTCAGATGAAACTAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTCCTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGAGCGATGCGGATAAGCTATtacattc > 1:44549/1‑250 (MQ=255) ccTGCGGGTCGTGCAGGGTCATGGCTCTCATCCACGCGTAGTGCGGCAGGCATGTGCCGACGACCCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATTTTGTTGCCTGCCATGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCTCATCGCTCGTATCCTTTCACCAGACTCCGTTCGCTATGCCGTTCAGCTATTTCATTCTGATTCTGTGCCGATTGAACATCTg < 1:42047/235‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTg < 1:42043/235‑1 (MQ=255) ggTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGtt > 1:143966/1‑250 (MQ=255) cAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCtgtg > 1:234754/1‑170 (MQ=255) cAGGTGCCGACGACGCCGATATGCNGNTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGNCTACTCACTTNTCANNACCCNTNANCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTANGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTNNATNNNGANNCtgtg < 2:234754/170‑1 (MQ=255) nccGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCCGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGAt > 1:39526/2‑224 (MQ=255) atGCTTGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCGCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGAGAAGCTATGTCAATCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTAGCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCTCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAggn < 1:38251/251‑2 (MQ=255) ttGCTNNAANNNGTNNAGATGAAACCAATATGGTTGCCTNCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCNTNANCGCANNGCTNGTATCCGTTCNCCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATg > 2:239198/1‑138 (MQ=255) ttGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATg < 1:239198/138‑1 (MQ=255) ncAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCCTCGCTAGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCTGATTGATCATCTGCTCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGCTAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCtat > 1:62393/2‑251 (MQ=255) tGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCAGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCAGTAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATggc > 1:22078/1‑251 (MQ=255) tgccAGGTAGCCTACTCATTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCNGTTNNNNNTc > 2:201210/1‑144 (MQ=255) aCTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGc < 1:234060/250‑1 (MQ=255) tttCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCGGAGGGTAAAGTCAGCCGGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTc < 1:46406/249‑1 (MQ=255) tttCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATGTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGTCGCATTGCAggt < 1:252770/168‑1 (MQ=255) ccTAATCGCATCGCTCGTATCCGTTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTAATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGcgcg > 1:216589/1‑250 (MQ=255) | CCAACGGTGAGCGTCTGCGGACCTTACAGGATAAATTTGACCTGCGGGTCGTGCAGGGGCATGGCTCTCATCCACGCGTATTGCGGGAGGCAGGTGCCGACGACGCCGATATGCTGGTTGCTGTAACCAGTTCAGATGAAACCAATATGGTTGCCTGCCAGGTAGCCTACTCACTTTTCAACACCCCTAATCGCATCGCTCGTATCCGCTCACCAGACTACGTGCGCGATGCCGATAAGCTATTTCATTCAGATGCTGTGCCGATTGATCATCTGATCGCACCAGAGCAGTTGGTTATCGATAATATTTACCGACTGATTGAGTATCCCGGCGCATTGCAGGTGGTGAACTTCGCTGAGGGTAAAGTCAGCCTGGCTGTGGTTAAAGCCTATTATGGCGGCCCGCTGATTGGTAATGCACTTTCGACCATGCGCG > NC_000913/3436609‑3437043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |