| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,897,819 | G→A | V296V (GTG→GTA) | sdaA → | L‑serine deaminase I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,897,819 | 0 | G | A | 100.0% | 10.0 / NA | 5 | V296V (GTG→GTA) | sdaA | L‑serine deaminase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (2/3); total (2/3) | |||||||||||
GCCGGATGCTGGTTTCCAGCGATAAACTGTCTAACGATCCGATGAATGTCATTGACTGGGTAAACATGTTTGCGCTGGCAGTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCAACGGTGCCTGCGGTATCGTTCCGGCAGTGCTGGCTTACTATGACCACTTTATTGAATCGGTCAGCCCGGACATCTATACCCGTTACTTTATGGCAGCGGGCGCGATTGGTGCATTGTATAAAATGAACGCCTCTATTTCCGGTGCGGAAGTTGGTTGCCAGGGCGAAGTGG > NC_000913/1897662‑1897961 | gcCGGATGCTGGTTTCCAGCGATAAACTGTCTAACGATCCGATGAATGTCATTGACTGGGTAAACATGTTTGCGCTGGCAGTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCAACGGTGCCTGCGGTATCGTTCCGGCAGTACTGGCTTACTATGACCACTTTATTGAATCGGTCAGCCCGGACATCTATACCCGTTACttt > 1:50660/1‑218 (MQ=255) nctntcgnanntnncGANGAAGGGCATGGACGGGGTAAANNTGTTTGCGCNGGCAGTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCANCGGTGCTTGNNGTNTTGTGNCNNNANNNCTNGCTGACTATGACCACTTTANTGNNTCGGTCNGCCCGGACATCTATACCCGTTACttt < 2:50660/179‑1 (MQ=255) gAATGTCATTGACTGGGTAAACATGTTTGCGCTGGCAGTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCAACGGTGCCTGCGGTATCGTTCCGGCAGTACTGGCTTACTATGACCACTTTATTGAATCGGTCAGCCCGGACATCTATACCCGTTACTTTATGGCAGCGGGCGCGATTGGTGCATTGTATAAAATGAACGCCTCTATTTCCGGTGCGGAAGTTGGTTGCCAGGNc < 1:170828/250‑1 (MQ=255) gTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCAACGGTGCCTGCGGTAGCGTTCCGGCAGTACTGGCTTAc < 1:75423/87‑1 (MQ=255) cgcCAACCAACGGTGCCTGCGGTATCGATCCGGCAGTACTGGCTTACTATGACCACTTTCTTGAATCGGTCTGCCCGGACATCtat > 1:123483/1‑86 (MQ=255) gTGCCTGCGGTATCGTTCCGGCAGTACTGGCTTACTATGACCACTTTATTGAATCGGTCAGCCCGGACATCTATACCCGTTACTTTATGGCAGCGGGCGCGATTGGTGCATTGTATAAAATGAACGCCTCTATTTCCGGTGCGGAAGTTGGTTGCCAGGGCGAAGTgn < 1:38329/168‑2 (MQ=255) | GCCGGATGCTGGTTTCCAGCGATAAACTGTCTAACGATCCGATGAATGTCATTGACTGGGTAAACATGTTTGCGCTGGCAGTTAACGAAGAAAACGCCGCCGGTGGTCGTGTGGTAACTGCGCCAACCAACGGTGCCTGCGGTATCGTTCCGGCAGTGCTGGCTTACTATGACCACTTTATTGAATCGGTCAGCCCGGACATCTATACCCGTTACTTTATGGCAGCGGGCGCGATTGGTGCATTGTATAAAATGAACGCCTCTATTTCCGGTGCGGAAGTTGGTTGCCAGGGCGAAGTGG > NC_000913/1897662‑1897961 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |