| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,527,399 | C→T | intergenic (+247/‑2523) | yncH → / → ydcD | DUF5445 domain‑containing protein YncH/uncharacterized protein YdcD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,527,399 | 0 | C | T | 100.0% | 15.5 / NA | 8 | intergenic (+247/‑2523) | yncH/ydcD | DUF5445 domain‑containing protein YncH/uncharacterized protein YdcD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (4/4); total (4/4) | |||||||||||
CGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCAATAGATTATCAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCACTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTT > NC_000913/1527182‑1527640 | cGCAATTATCTGTAGGCCAAATATGGACAGCTTGATGAGTACGAGCTAAAACAGCAATTACTTAATAAACATGTTGATTTATTGACGAAAATGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCATTAGATTATAAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCATTGa > 1:180958/1‑221 (MQ=255) agCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCAATAGATTATCAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCTTTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCgggg < 1:85504/251‑1 (MQ=255) gCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAACTGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCAATAGATTATCAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCATTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCggggg > 1:84863/1‑251 (MQ=255) gTCAGAGCTAAAACAGCAAATGATTAATAAACATGTTGATTTAGTTAAGAAAACGGATGTAGTTTAAATGTGGATTCTTAAGATAACCTAATCAATAGAGTATCAAGTGAGAGCTACACATCATTGGAGTGGCAGTGTAAAACACCATTTTCGGAACAATGCATCCGGTACTCTTACCATTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAggtggttg < 1:89234/211‑3 (MQ=255) caTTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCATTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGGGGTGCAGTGCTTTGGaa > 1:18458/1‑108 (MQ=255) ngngCNGGGGANAACANCATTTTGGGAACAATNCATCAGGTACTCTTACCATNNANGCAAGntcatc < 2:85204/66‑1 (MQ=255) ttGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCATTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGGGTTTAACGACTTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTcc < 1:37674/250‑1 (MQ=255) ctctTACCATTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTCTACAAACCATCATTCAttt > 1:33848/1‑251 (MQ=255) | CGCAATTATCTGTAGGACAAATATGGAGAGCTTGATGAGTCAGAGCTAAAACAGCAATTGATTAATAAACATGTTGATTTATTCAAGAAAATGGATGTATTTTAAATGTTGATTCTTAATATAACCTAATCAATAGATTATCAAGTGAGAGCTACACATTATTGGAGGGGCAGGGGAAAACACCATTTTGGGAACAATGCATCAGGTACTCTTACCACTGAAGCAAGATCATCCGGCACCAGGTGGTGGTGCAGTGCTTTGGAAATGGTCCCCTCGGGGGAGTTGTCATTATTTTCTATGCTATTTGCTTATTATATTCATCAGGTGAATTTAATAAATTCCTAATTTGAAATATCCACTATTAAGCTAGTGTTTAACGACGTTAAGATGGCAATGTGCAGATCATGTTATCAGGGTGGGGCGGTAGCGTATATTCCTTATACAAACCATCATTCATTT > NC_000913/1527182‑1527640 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |