| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,582,054 | C→T | C332Y (TGT→TAT) | hsdM ← | type I restriction enzyme EcoKI methylase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,582,054 | 0 | C | T | 100.0% | 11.8 / NA | 7 | C332Y (TGT→TAT) | hsdM | type I restriction enzyme EcoKI methylase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (2/5); total (2/5) | |||||||||||
GCTCGTCGGTAAACGGTGTGCGCTTGCCGAAACTCGGCATATTGGTACGCAGGTCATACACCCACACATCATCGGTACAGTTCTTATCCTGATTCGGGTTCGCCACCGTCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCG > NC_000913/4581860‑4582290 | gCTCGTCGGTAAACGGTGTGCGCTTGCCGAAACTCGGCATATTGGTACGCAGGGCATACCCCCACACATCATCGGTACAGTTCTTATCCTGATTCGGGTTCGCCACCGTCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACg < 1:102145/251‑1 (MQ=255) cGCCACCGTCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAgg > 1:1107/1‑251 (MQ=255) ttGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCgg < 1:122573/94‑1 (MQ=255) cGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATAGTCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCggg < 1:157388/207‑1 (MQ=255) cGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGcc > 1:160494/1‑251 (MQ=255) ggTGTGCAGATTATACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCCCCACCCCCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTTTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCg < 1:90756/250‑1 (MQ=255) gtggccAGATGATCCTTATCCATCAGGTCACGAAGAATTTCGGTGCCTTCACCTCCTGCAAAGAGCACGTTATCCGCCACCACCCCCGCCGCACGACCGCCGGGATGCATCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGTTGAACAAAGGTGCGTGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGc < 1:213301/194‑1 (MQ=255) | GCTCGTCGGTAAACGGTGTGCGCTTGCCGAAACTCGGCATATTGGTACGCAGGTCATACACCCACACATCATCGGTACAGTTCTTATCCTGATTCGGGTTCGCCACCGTCCCTTTGGTAAAGAACAGCACGTTGGTCTTCACGCCCTGAGCGTAAAAAATACCGGTCGGCAGACGCAGAATGGTGTGCAGATGACACTTATCCATCAGGTCACGACGAATGTCGGTGCCTTTGCCGCCTTCAAACAGCACGTTATCCGGCACCACCACCGCCGCACGACCGCCGGGATGCAGCGTTTCGATAATATGCTGCATAAAGCACAACTGTTTGTTGCTGGTCGGGTGAACAAAGGTGCGGGTAATGTTGGTGCCTGCGGCGCTGCCAAACGGCGGGTTAGTGGCGACAATATGCGCCTTCGGCAGGTTTTCACCG > NC_000913/4581860‑4582290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |