| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,268,970 | A→G | T186A (ACA→GCA) | yhaC → | uncharacterized protein YhaC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,268,970 | 0 | A | G | 100.0% | 13.7 / NA | 6 | T186A (ACA→GCA) | yhaC | uncharacterized protein YhaC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (4/2); total (4/2) | |||||||||||
CGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGA > NC_000913/3268749‑3269151 | ctttAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGACATCCGGAGGTTAAACGTACTTTTTAGTTGAGGGCCTGGCGATATCGTTGATCTCTCCTCTCTGGACTTACGTACTGTCGATTTAGCTTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTc > 1:233537/3‑249 (MQ=255) ngAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGtt > 1:65445/2‑250 (MQ=255) aCTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACAGATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTAATAATGCCAACATGTTTCAGGTGAATTTTGTTAGTTCAACCCAAAACTCCACAATCTCCTGGGATTATGTACGAAAAATACCGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAg < 1:38963/251‑1 (MQ=255) aaTGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTANNAATGCCNNc > 2:22146/1‑99 (MQ=255) aaTGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAacac < 1:22146/130‑1 (MQ=255) gATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAGCAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCga > 1:108991/1‑248 (MQ=255) | CGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGGACTGGAGATATCGTTGATCTATCCTCTCTGGACTTACGTAATGTCGATTTAGATTATTATGATTTCACAGATAAACATATGGCTAATACTATTTTAAATCCTTTTAAATTGAATTCAACAAATTTTACTAATGCCAACATGTTTCAGGTTAATTTTGTTAGTTCAACACAAAACGCCACAATCTCCTGGGATTATTTACTAAAAATAACGCCTGTTTTAATAAGCATTAGCGATATGTATTCTGAAGAAAAAATCAAGTTTGTCGAAAGTTGTTTAAATGAGCCTGGAGACATTACCGA > NC_000913/3268749‑3269151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |