| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,943,893 | C→T | A186V (GCT→GTT) | csdA → | cysteine sulfinate desulfinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,943,893 | 0 | C | T | 100.0% | 15.5 / NA | 8 | A186V (GCT→GTT) | csdA | cysteine sulfinate desulfinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (2/6); total (2/6) | |||||||||||
AACCGGGCGATGAGATTATTGTCAGCGTGGCAGAACACCACGCCAACCTCGTCCCCTGGCTGATGGTCGCCCAACAAACTGGAGCCAAAGTGGTGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTTCCCCGCGGATGTTCAGCAACTGGATATTGATTTCTATGCTTTTTCAGGTCACAAACTGTATGGCCCGACAGGTATCGGCGTGCTGTATGGTAAATCAGAACTGCTGGAGGCGATGTCGCCCTGGCTGGGCGGCGGCAAAATGGTTCACGAAGTGAGTTTTGAC > NC_000913/2943656‑2944110 | aaCCGGGCGATGAGATTATTGTCAGCGTGGCAGAACACCACGCCAACCTCGTCCCCTGGCTGATGGTCGCCCAACAAACTGGAGCCAAAGTGGTGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCGGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCggn < 1:52990/251‑2 (MQ=255) ggCTGATGGTCGCCCAACAAACTGGAGCCAAAGTGGTGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACGCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGTGGCAGTGCATTTCCCCGCGGATGTTc < 1:161168/249‑1 (MQ=255) aCTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTGCCCCGCGGATGTTCAGCAACTGGATATTGATTTCTATTCGTTTTCAGGTCACAAACTGTATGGCCCGACAGGTATCGGCGTGCTGTATg < 1:247774/236‑1 (MQ=255) cGAACNNTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCa < 2:14376/95‑1 (MQ=255) gTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGAAGGATGATGGTGCTCCGGGGGCAGTGCATTTCCCCGAGGATGTTCAGCAACTGGATATTGCTTTCTATGCTTTTTCAGGTCACAAACTGTATGGCCCGACAGGTATCGGCGTGCTGTATGGTAAATCAGCACTGCTGGAGGGGATGTCGCCCTGGCTGGGCGGCGGCACAATGGTTCACGACGTGCGTTTTGAc > 1:130063/1‑251 (MQ=255) gCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTTCCCNNCGGATGNNc > 2:16199/1‑99 (MQ=255) gCCCGGATCTGCAGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTTCCCCGCGGATGTTCAGCa < 1:16199/103‑1 (MQ=255) tCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGTTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTTCCCCGCGGATGTTCAGCAACTGGATATTGATTTCTATGCTTTTTCAGGTCACAAACTGTATGGCCCGACAGGTATCGGCGTGCTGTATGGTAAATCAGAACTGCTGGAGGCGATGTCGCCCTGGCTGggc < 1:41871/208‑1 (MQ=255) agcgaNTANCNTTNNTNATTCNGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCngng > 2:121038/1‑64 (MQ=255) | AACCGGGCGATGAGATTATTGTCAGCGTGGCAGAACACCACGCCAACCTCGTCCCCTGGCTGATGGTCGCCCAACAAACTGGAGCCAAAGTGGTGAAATTGCCGCTTAATGCGCAGCGACTGCCGGATGTCGATTTGTTGCCAGAACTGATTACTCCCCGTAGTCGGATTCTGGCGTTGGGTCAGATGTCGAACGTTACTGGCGGTTGCCCGGATCTGGCGCGAGCGATTACCTTTGCTCATTCAGCCGGGATGGTGGTGATGGTTGATGGTGCTCAGGGGGCAGTGCATTTCCCCGCGGATGTTCAGCAACTGGATATTGATTTCTATGCTTTTTCAGGTCACAAACTGTATGGCCCGACAGGTATCGGCGTGCTGTATGGTAAATCAGAACTGCTGGAGGCGATGTCGCCCTGGCTGGGCGGCGGCAAAATGGTTCACGAAGTGAGTTTTGAC > NC_000913/2943656‑2944110 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |