| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,865,376 | C→T | F92F (TTC→TTT) | ygbN → | putative transporter YgbN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,865,376 | 0 | C | T | 100.0% | 25.9 / NA | 12 | F92F (TTC→TTT) | ygbN | putative transporter YgbN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (2/10); total (2/10) | |||||||||||
AAAGGTACAACCATTCGTTGCTTTGCTCCTCGTCAGCCTGTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTCAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCGGCTTTATTATTCTTGCGCCAATCATTTACGGTTTTGCCAAGGTTGCCAAAATATCGCCACTCAAATTTGGCCTGCCTGTCGC > NC_000913/2865172‑2865543 | aaaGGTACAACCATTCGTTGCTTTGCTCCTCGTCAGCCTGTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATcgctgcgcn < 1:24085/243‑2 (MQ=255) cctcGTCAGCCTGTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGcn < 1:159305/185‑2 (MQ=255) tcGTCAGCCTGTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTTGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGTGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGGAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGtn < 1:47878/192‑2 (MQ=255) gTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCCAAGGGGGTAAAGTGGTTATTCCCGGGGTGGGGGGCGTGGTTTTTTCCCTCCCTATTATTCTTCATCTTGGCGCTTCGCTGGGGCGTATGATCCAACACTCTGGTGGTGACGAGGCACTGGCTCATTATTTTAGTCGCACGTTAGGGGACAAACCAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGGTCTTCCTCGGGATTCCCGTCTTCttttatttcg > 1:99413/1‑244 (MQ=255) tggCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTcc < 1:227056/209‑1 (MQ=255) ccGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTTGTTCCGGCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTANTTANNNNNGtnnnnnn > 2:155479/1‑144 (MQ=255) ncgggcgAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGtc > 1:77709/2‑210 (MQ=255) gTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTAGTTTAGTCGCAAGTTAGGTg < 1:87646/141‑1 (MQ=255) gTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTAGCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCGGCTTTATTATTCTTGCGCCAATCATTTACGGGTTTGCCAAGGTTGc < 1:212677/251‑1 (MQ=255) gTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGt < 2:155900/99‑1 (MQ=255) gTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCGGCTTTATTATTCTTGCGCCAATCATTTACTGTTTTGCCAATGTTGCCAAAATATCGCCACTCAAATTTGGCCTGCCTGTCGc < 1:130246/251‑1 (MQ=255) aCTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTTAGGCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTTCGCGGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCgg < 1:117807/167‑1 (MQ=255) ttattTTAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCGGCTTTATTATTCTTGCGCCAATCATTTACGGTTTTGCCAAGGTTGCCAAAATATCGCCACGCAAATTTGgcctgn < 1:67196/167‑2 (MQ=255) | AAAGGTACAACCATTCGTTGCTTTGCTCCTCGTCAGCCTGTTAGTCGCACTTGCGGCAGGTATACCGGCGGGCGAAGTGGGTAAAGTGATGATCGCCGGGATGGGCGGTGTGCTTGGTTCCGTCACTATTATTATTGGTCTGGGCGCTATGCTGGGGCGTATGATCGAACACTCTGGTGGTGCAGAGTCACTGGCTAATTATTTCAGTCGCAAGTTAGGTGACAAACGAACTATCGCTGCGCTGACTCTGGCAGCGTTCTTCCTCGGTATTCCCGTCTTCTTTGATGTCGGCTTTATTATTCTTGCGCCAATCATTTACGGTTTTGCCAAGGTTGCCAAAATATCGCCACTCAAATTTGGCCTGCCTGTCGC > NC_000913/2865172‑2865543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |