| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,167,940 | C→T | G114G (GGC→GGT) | ycfJ → | PF05433 family protein YcfJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,167,940 | 0 | C | T | 98.1% | 155.7 / NA | 53 | G114G (GGC→GGT) | ycfJ | PF05433 family protein YcfJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (27/25); total (28/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 | |||||||||||
ATACGCTCAGGTTGTTTCTGCAACCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGCTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAGGCTGTACTCTG > NC_000913/1167697‑1168153 | aTACGCTCAGGTTGTTTCTGCAACCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTcc > 1:15218/1‑251 (MQ=255) cAGGTTGTTTCTGCAACCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGaa > 1:154600/1‑249 (MQ=255) ggTTGTTTCTGCAACCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCg > 2:241511/1‑251 (MQ=255) aaCCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGCCAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCAACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCAGGTAACCAAATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGGGATACTTaca > 2:387998/1‑248 (MQ=255) aaCCCCAAACAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCGGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGa < 2:154600/251‑1 (MQ=255) ccccAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGCGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGCGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGGTATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACt > 2:216995/1‑251 (MQ=255) cAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACg < 1:575770/251‑1 (MQ=255) aTCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTTGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCa < 2:278509/251‑1 (MQ=255) gcgTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATg < 1:439926/251‑1 (MQ=255) cgTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGa < 1:147395/251‑1 (MQ=255) cAACGTCACAGTCACTCATCGTCGACCGATGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGAGCTCGGCGCTGTTGCTGTCGGCGTGATAGTGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGGGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGGTCAAGGGTTCTCTCCAGGAAAGGGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGAGTATGACAAGGCAGaaaaa > 2:379991/1‑250 (MQ=255) cGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGc < 1:323668/251‑1 (MQ=255) acaGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCgg > 1:296774/1‑251 (MQ=255) 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ccGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCtata > 2:581347/1‑250 (MQ=255) gTGCAGTAAGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCAGCACTGTCTCTGGCCGAGTGATAGCGCATCAGTTTGGGGGAGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGGGTTGGATATGCCGGTAACCCAATCCAGGGTTCTCTCCAGGACAGCGATACTTACACGCCTACTCCACAGCGTTGTAACACGGTTGATACCAAGTAAGCAAAAATCCTCGGGTATGATGTGACCtatc > 2:318205/1‑246 (MQ=255) gCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTg > 1:644323/1‑251 (MQ=255) aGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGc > 1:424861/1‑251 (MQ=255) ggATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCg < 2:450048/251‑1 (MQ=255) aTGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCAACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAAAGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGAt > 1:2109/1‑251 (MQ=255) aTTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCa > 1:6620/1‑250 (MQ=255) ccGGGTCGGTGCTCTGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGATTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGAGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTACAGGAAAGCGAGACTTACACGACTACGAAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATAAGCAGGGCAAAATc > 2:619721/1‑251 (MQ=255) cGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATcc < 1:241511/251‑1 (MQ=255) gggacggggCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGGTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGGCGCCACTGTTGTGGGGGAGCTGGGTGGTGGGTATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTGCTCTACAGGAAAGCGATACTGACACGACTACGCAAAAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAACAATGCTCGGTTATGATGTAAACTATAAGCATGGCGATCAGCAGGACAAAATCCg > 2:430383/9‑251 (MQ=255) gTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCa < 1:603447/251‑1 (MQ=255) gcGGTGGTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCAt < 2:149800/250‑1 (MQ=255) tCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACcgc > 1:477722/1‑251 (MQ=255) ttGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCAt < 2:114001/235‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCAt > 1:114001/1‑235 (MQ=255) gCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGGAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGAGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGCGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTAc > 1:222445/1‑251 (MQ=255) tGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGc > 2:212063/1‑251 (MQ=255) gggcggcGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGc < 1:568588/250‑1 (MQ=255) gcgTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGAGCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATc < 1:281537/251‑1 (MQ=255) aTAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGGTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTGCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAAGCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGAGCCCGCt < 2:457969/251‑1 (MQ=255) gCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTTCACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATa < 1:28041/251‑1 (MQ=255) gCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATa < 2:170465/251‑1 (MQ=255) cATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGAt > 2:307466/1‑249 (MQ=255) cATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGAt > 1:411032/1‑249 (MQ=255) cAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAATATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCa < 2:654461/92‑1 (MQ=255) 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cgcgGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTTGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCATGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACTGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCACCGGGCAACTGAttt < 2:399682/250‑1 (MQ=255) aGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGTGTGGTGGATATGCCTGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACa < 1:379991/251‑1 (MQ=255) gCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGtata < 1:30665/251‑1 (MQ=255) cACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGCTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTAAGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCAGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGAATAAc > 1:75308/1‑251 (MQ=255) tgttgtGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACa > 2:448838/1‑249 (MQ=255) gttgtGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAg < 1:162267/250‑1 (MQ=255) tgGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAGGCTGt > 1:308251/1‑251 (MQ=255) gggggAGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGAGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGATAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAGGCTGTa < 2:244752/251‑1 (MQ=255) cgcTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGTTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACTCAGATCCCTCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAGGCTGTACTCTg < 1:142492/251‑1 (MQ=255) | ATACGCTCAGGTTGTTTCTGCAACCCCAATCAAGGAAACGGTTAAAACACCGCGTCAGGAGTGTCGCAACGTCACAGTGACCCATCGTCGACCGGTGCAGGATGAAAATCGCATTACCGGGTCGGTGCTCGGCGCTGTTGCTGGCGGCGTGATAGGGCATCAGTTTGGTGGTGGTCGCGGTAAAGATGTCGCCACTGTTGTGGGGGCGCTGGGTGGTGGATATGCCGGTAACCAGATCCAGGGCTCTCTCCAGGAAAGCGATACTTACACGACTACGCAACAGCGTTGTAAAACGGTGTATGACAAGTCAGAAAAAATGCTCGGTTATGATGTGACCTATAAGATTGGCGATCAGCAGGGCAAAATCCGCATGGACCGCGATCCGGGTACGCAGATCCCGCTAGATAGCAACGGGCAACTGATTTTGAATAACAAAGTATAACAAGGCTGTACTCTG > NC_000913/1167697‑1168153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |