| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 51,712 | C→T | G240E (GGA→GAA) | rsmA ← | 16S rRNA m(6)2A1518,m(6)2A1519 dimethyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 51,712 | 0 | C | T | 97.5% | 270.0 / NA | 81 | G240E (GGA→GAA) | rsmA | 16S rRNA m(6)2A1518,m(6)2A1519 dimethyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (35/44); minor base G (0/2); total (35/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
CAACAACTGCACTGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAACCGGGTGAGGCATCGTTGCATGAGGAACCAGGCGCACGACGGCGGAATCCACTTTGGGTGGTGGTGTAAAGGCTGACGGCGGTACTTCCAGTACCGGGATCA‑CATTGCAATAGTATTGCGCCATGACGCTTAATCG > NC_000913/51469‑51956 | caacaaCTGCACTGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTaa < 1:370345/251‑1 (MQ=255) caacTGCACTGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTAacac > 1:527476/1‑251 (MQ=255) aaacTGCACGGGCGGTCGCCCCAGATTGCGGATGGGTACGGTAGAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGATCCTGAATACACACTCGGGGCTAATTGATCATCGTTAACGCTCCTGCAAAGGCGCGTGCGCCGCCAGATAGTTCGCGATCTGGCAATATTGCGCTGCAGAGATATTTTCCCCTCGCATCGCCGGGTCGATAGCCATTTCCGTTAacac < 2:292535/250‑1 (MQ=255) gCACTGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTAAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTAACACCTCg < 1:605332/250‑1 (MQ=255) cGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAg < 1:324794/250‑1 (MQ=255) gCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGt > 1:450799/1‑251 (MQ=255) ccccAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTTCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGtt < 1:178239/251‑1 (MQ=255) 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CAACAACTGCACTGGCGCTCGCCCCAGATTGCGTATGGTTACGGTATAAGCAAAAACGTAACGTTCATTATCAGGTGAAGATTGAGCCTCAATGTAGACGCTTTGAACCTGAATACACACTCGGGGCGAATTGATCATCGTTAACTCTCCTGCAAAGGCGCGTTCTCCGCCAGATAGTTCGCCATCTGGCAATATTGCGCGACAGAGATATTTTCCGCTCGCATCGCCGGGTCGATCCCCATTCCCGTTAACACCTCGACGCTAAACAGGTTGCCGAGGCTGTTACGAATGGTTTTACGACGCTGGTTAAAGGCTTCGGTGGTGATGCGGCTCAACACACGAACATCTTTAACCGGGTGAGGCATCGTTGCATGAGGAACCAGGCGCACGACGGCGGAATCCACTTTGGGTGGTGGTGTAAAGGCTGACGGCGGTACTTCCAGTACCGGGATCA‑CATTGCAATAGTATTGCGCCATGACGCTTAATCG > NC_000913/51469‑51956 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |