| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,295,679 | G→A | G400D (GGT→GAT) | gltP → | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,295,679 | 0 | G | A | 98.0% | 161.0 / NA | 49 | G400D (GGT→GAT) | gltP | glutamate/aspartate : H(+) symporter GltP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (26/22); minor base C (1/0); total (27/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
ATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTC > NC_000913/4295444‑4295914 | aTTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGt < 1:137783/251‑1 (MQ=255) gCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCt > 2:68682/1‑251 (MQ=255) tCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAATGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTg < 1:339430/249‑1 (MQ=255) tCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCTCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGc < 1:154901/250‑1 (MQ=255) tCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGAt < 1:205904/247‑1 (MQ=255) tCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGAt < 1:240660/247‑1 (MQ=255) tGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCATGGGGGAacac > 2:315807/1‑251 (MQ=255) ccTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑Gt > 1:16591/1‑250 (MQ=255) tGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGATTGCCAAGGGGGAACACAAATTTGCCC‑GTACGAAAgcgcg > 1:391648/1‑250 (MQ=255) ggCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTTCCAAGTGGGAACACAAATGTGACC‑GTAAGAAAGCGCTg < 1:351337/251‑1 (MQ=255) ggCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAgcg < 1:321347/248‑1 (MQ=255) gTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTTTGAGCGTGAAGt > 1:342240/1‑251 (MQ=255) tGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGGGGGAACAAAAATTTTAAC‑GTAAGAAAGGGCTGGCCTATGAGCGTGAAGGGCTGGGCaa > 2:91068/1‑250 (MQ=255) tGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTCGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGGGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGGGGATAATTCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGAGGGAACACCAATTTTACCCGAAACAAAG‑GCTGGCTTATGAGCGCTAAGTGCTTGTTAAATTTGAt > 2:76766/1‑251 (MQ=255) cTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGGACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATaaa > 1:370213/1‑250 (MQ=255) ggcttGCCTTGCGTGTCTATTGTGGTGTTGCTGGCACCGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGATGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATCGCAAAGTGGGAACACAAATTTTACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAAtt < 1:165946/247‑1 (MQ=255) ggCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCaataat < 2:342843/250‑1 (MQ=255) gCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTTCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTTATAAAACTGCGGATCAATAATTg < 2:234005/251‑1 (MQ=255) ggcTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGa < 2:191130/249‑1 (MQ=255) gCCTGGCGTGTCGAATGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGCAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGGTTGCCAAGTGGGCACACAAATTTGACC‑CTAAGAAAGCGCCGGCTTATGAGCGGGAGGTGCTCGGCAAATTTGATAAAACTGCGGACCAATAAttta > 2:48622/1‑246 (MQ=255) cTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTCAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGAtt > 1:5403/1‑251 (MQ=255) gtgtCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGGTTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATCAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGACgg > 1:35069/1‑251 (MQ=255) 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tggtgTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGCTACTGCGCTGGCGGTGCTGGCGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCCATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCAc > 1:363937/1‑251 (MQ=255) ggtgTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGATGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAACCTGCGGAACAATAATTGAAGATTGTCGGGGATATCCAcc > 1:129295/1‑251 (MQ=255) tGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACCCAAATTTGACC‑GTAAGAAAGGGCTTGCTTATGAGGGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGGGGATCAATATTTTAAGATTGCCGGGGGTATTCACCCGGc > 2:333181/1‑250 (MQ=255) tGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGAGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGAGCTGGTGATTGCCAAGGGGGAAAAAAAATGTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTACTGGGCAAATTTGATAAAACGGCGGATCAATAATTGAAGAATACCGGGGACAACCACCCgga > 2:111700/1‑249 (MQ=255) tAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTg > 1:226373/1‑250 (MQ=255) tAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTCGGGATCAATAATTGAAGATTGACGGGGATATCCCCCCCGCAATGTGTGAATGCCTg > 2:313882/1‑250 (MQ=255) cTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGAGCTGGCTTATGAGCGTGAAGGGCTGGGCAAATTTTATAAAAATGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCcgcg > 2:378990/1‑251 (MQ=255) gTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAAGTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGGAATTGGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATc > 2:235671/1‑251 (MQ=255) ggCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGATTGCCAAGAGGGGACACAAATTTGGAC‑GTAAGGAAGCGCTGGCTTATTAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGc > 2:266268/1‑251 (MQ=255) ttATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:135319/1‑251 (MQ=255) ttATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGGGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 1:22243/1‑251 (MQ=255) tATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACg < 1:280808/250‑1 (MQ=255) 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cGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGc < 1:213102/251‑1 (MQ=255) aTCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCTCCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGcatg < 2:326735/251‑4 (MQ=255) ccGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCTGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTTATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGAttt < 1:48622/250‑1 (MQ=255) aTGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCCAGGGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGGGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCgg > 1:58864/1‑250 (MQ=255) ggcgTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGAtt < 2:316822/250‑1 (MQ=255) gTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTTCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTg < 1:227992/251‑1 (MQ=255) gTACTGCGCTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTg < 2:326001/251‑1 (MQ=255) ggcgcTGAACGTGGTTGATACAGCGCTGGCGGGGATGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATGTGACC‑GTAAGAAAGCGATGTCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAGGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGAGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCACAATAGCCTGATTTGGCGTGATTTTGTAgg < 2:297475/250‑1 (MQ=37) cgcTGAACGTGGTGGATAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTc > 2:167385/1‑251 (MQ=255) | ATTGCCGCTATCTTCATCGCGCAGTTGTATGGCATTGACCTGTCCATCTGGCAGGAAATCATTCTGGTGCTGACGCTGATGGTGACCTCGAAAGGGATTGCTGGCGTGCCTGGCGTGTCGTTTGTGGTGTTGCTGGCAACGCTGGGTAGCGTAGGTATTCCGCTGGAAGGTCTGGCGTTTATTGCTGGTGTTGACCGTATCCTCGACATGGCGCGTACTGCGCTGAACGTGGTGGGTAATGCGCTGGCGGTGCTGGTGATTGCCAAGTGGGAACACAAATTTGACC‑GTAAGAAAGCGCTGGCTTATGAGCGTGAAGTGCTGGGCAAATTTGATAAAACTGCGGATCAATAATTGAAGATTGCCGGGGATATCCACCCGGCAATGTGTGAATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGCCAGACAGCGCAATAGCCTGATTTAGCGTGATTTTGTAGGTC > NC_000913/4295444‑4295914 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |