| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 702,720 | G→A | T11I (ACC→ATC) | nagA ← | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 702,720 | 0 | G | A | 100.0% | 150.3 / NA | 45 | T11I (ACC→ATC) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (22/23); total (22/23) | |||||||||||
GTACAGCCTGATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGGTAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTAAAAAATATTGCCCTGAGCAAGGAGCCAGGGCAGGGATAACAATTACAGACCTTTGATATTTTCTGCTTCTAATTCATTGAAATATCTTAAAGTCTTAACTTTCAGCTCCATGGTGGAAGGTTCATCGCACACCATGATCGCTTTCGGATGCAGTTGCAGACAGCTGATGGTCCACATATGGTTCACGCAACCTTCAAC > NC_000913/702474‑702966 | gtACAGCCTGATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATaa > 1:58791/1‑250 (MQ=255) tACAGCCTGATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACCACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGGGGCCGATaa > 2:32088/1‑249 (MQ=255) aCAGCCTGATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATaa > 1:30741/1‑248 (MQ=255) gATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCgg < 1:198038/249‑1 (MQ=255) aTTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGccc < 2:79910/251‑1 (MQ=255) ttCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCt < 2:113673/250‑1 (MQ=255) tctcATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTg < 2:86148/250‑1 (MQ=255) cATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGt < 1:371134/250‑1 (MQ=255) ggCTTTCTGCATGATTGCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGGTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATg < 2:70751/251‑1 (MQ=255) gCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACAt < 1:415084/250‑1 (MQ=255) gATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTg < 1:302520/250‑1 (MQ=255) gTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGACGTTAAACTGTACGCAGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCACGATCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGATACCGGACAGACGGTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTAGTGGCCGATAAAGATCCGGACCTGGGATAATGCATACGTTCGGACCCCCGAttt > 2:145110/1‑251 (MQ=255) ttCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGAtttt > 1:140085/1‑250 (MQ=255) 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cTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTCCGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACCTAGATAATACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGACCGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGATCCGCTACCGGACAGACGGTTTTAATCAGGACATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAACGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCACCGCTTTTAAACAATATTGCCCt > 2:254436/1‑251 (MQ=255) aGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTAAAAAATATTGCCCTGAGc > 1:144107/1‑251 (MQ=255) ccgcAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTAAAAAATATTGCCCTGAGCAAGGAGCCAGGGCAGGGATAACAAt < 2:30741/251‑1 (MQ=255) 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ggACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTAAAAAATATTGCCCTGAGCAAGGAGCCAGGGCAGGGATAACAATTACAGACCTTTGATATTTTCTGCTTCTAATTCATTGAAATATCTTAAAGTCTTAACTTTCAGCTCCATGGTGGAAGGTTCATCGCACACCATg > 2:16779/1‑251 (MQ=255) cAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTaaaaaa < 1:86045/103‑1 (MQ=255) cAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGATAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTaaaaaa > 2:86045/1‑103 (MQ=255) cAGGCAATCCGCGGTAACAACCGCGTAGTAATCCAGAACCTCATGCCCGATAACCATACGGCCCTGGGTTAATGCCTACATTCTGAGCCCCGATTTTACAAAATATTGCCCTGAGCAAGAACCCAGGGCAGGGCTCATGATTACAGACCTTGGATATTTTCTGCTTCTAATTCATTGAAATATCTTAAAGTCTTAACTTTCAGCTCCATGGAGGAAGGATCATCGCACACACTGATCGCTTTCGGAtna > 2:420695/1‑247 (MQ=255) 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GTACAGCCTGATTTCTCATTGGCTTTCTGCATGATTTCCAGCGTTTCCACGCTGACCGCTTCAGCGGTGTCGTTAAACTGTACGCCGCCGCAGCCGTTTAACTGCACATCGATAAAACCGGGGGAGAGAATGGCCCCGTTCAGTGAACGTTGTTCGATCTCTGGCGGCAGTTCCGCTACCGGACAGACGCTTTTAATCAGGCCATCAGCGATAACAACCGCGTGGTCATCAAGAAATTCGTGGCCGGTAAAGATCCGGCCCTGGGTTAATGCATACATTCTGACCCCCGATTTTAAAAAATATTGCCCTGAGCAAGGAGCCAGGGCAGGGATAACAATTACAGACCTTTGATATTTTCTGCTTCTAATTCATTGAAATATCTTAAAGTCTTAACTTTCAGCTCCATGGTGGAAGGTTCATCGCACACCATGATCGCTTTCGGATGCAGTTGCAGACAGCTGATGGTCCACATATGGTTCACGCAACCTTCAAC > NC_000913/702474‑702966 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |