| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 492,872 | G→A | G261S (GGC→AGC) G261S (GGC→AGC) |
dnaX → dnaX → |
DNA polymerase III subunit tau DNA polymerase III subunit tau |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 492,872 | 0 | G | A | 99.1% | 378.0 / NA | 108 | G261S (GGC→AGC) G261S (GGC→AGC) | dnaX dnaX | DNA polymerase III subunit tau DNA polymerase III subunit tau |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (43/63); total (44/64) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GTCGAGCAAATTCGCCATCAGCTTGAGCACATCCTCAACGAAGAACATATCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGTCGAGGCCAACGGCGAGCGCGTAATGGCGCTGATTAATGAAGCCGCTGCCCGTGGTATCGAGTGGGAAGCGTTGCTGGTGGAAATGCTCGGCCTGTTGCATCGTATTGCGATGGTACAACTTTCGCCTGCTGCACTTGGCAACGACATGGCCGCCATCGAGCTGCGGATGCGTGAACTGGCGCGCACCATACCGCCGACGGATATTCAGCTTTACTATCAGACGCTGTTGATTGGTCGCAAAGAATTACCGTATGCGCCG > NC_000913/492629‑493120 | gTCGAGCAAATTCGCCATCAGCTTGAGCACATCCTCAACGAAGAACATATCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGTCGAGGCCAACAGCGAgc < 2:395766/250‑1 (MQ=255) gcaacagcGCCATCAGCTTGAGCACATCCTCAACGAAGAACATATCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCGGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCTATGGTCGAGGCCAACAGCGAGCGCGTaa < 2:96391/244‑1 (MQ=255) gCAAATTCGCCATCAGCTTGAGCACATCCTCAACGAAGAACATATCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGTCGAGGCCAACAGCGAGCGCGTaa < 1:41089/251‑1 (MQ=255) aaTTCGCCATCCGCTAGAGCACAACCTCAACGAAGAACATAACGCTCACGAGCCGAGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGTGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCCTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAAACCAAGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAAGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGACGCGGCCCACAGCGAGGGCGGAATgg > 2:45956/1‑251 (MQ=255) aaTTCGCCATAAGATTGAGCACATCCTCAACGAAGAACATATCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGAGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGACGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGTCGAGGCCAACAGCGAGCGCGTAATgg > 2:438277/1‑251 (MQ=255) aaTTCGCAATCAGCTTGAGCACATCCTCAACGAAGAACCTATCGCTCACGAGCCGCGGGAGCTGCAAATGCTGACACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGCGATGCCCTAAGGCTGACCGACCCGGCGATTGCCAGCGGTCGCGGCCAGGTTTCAGCCCAGGCGGCCAGTGCGATGCCGGGTACGCGTGACGACGATCACTCGCTGGCGCTGGTAGAGGCGAGGGACGTGGCCAACAGCGTGCGCGAAATgg > 2:28959/1‑251 (MQ=255) ttCGCCATCAGCTTGAGCACATCCTCACCGAAGAACATCTCGCTCACGAGCCGCGGGCGCTGCAATTGCTGGCACGCGCCGCTGAAGGCAGCCTGCGAGATGCCTTAAGTCTGACCGACCAGGCGATTGCCAGCGGTGACGGCCAGGTTTCAACCCAGGCGGTCAGTGCGATGCTGGGTACGCTTGCCGACGATCAGGCGCTGTCGCTGGTTGAAGCGATGGTCGAGCCCAACAGCGAGCGCGTAATGgcc > 2:294828/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |