| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 469,384 | G→A | A172T (GCG→ACG) | mdlA → | ABC transporter family protein MdlA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 469,384 | 0 | G | A | 98.3% | 188.2 / NA | 59 | A172T (GCG→ACG) | mdlA | ABC transporter family protein MdlA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (24/33); total (25/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
GTTGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGGCGAT‑CATGATTAAGCGCAACGGCGATGCTTTGCATGAACGCTTTAAGCTGGCACAGGCGGCGTTTTCCAGTCTTAATGACCGCACCCAGGAAAGCCTCACCAGTATCCGCATGATCAAAGCCTTTGGTCTGGAAGATCGCCAGTCGGCGTTATTTGCCGCGGATGCCGAAGATACCGGCAAAAAAAACATGCGGGTGGCGCGTATTGATGCTCGTTTCGACCCGACCATCTATATCGCGATTG > NC_000913/469138‑469627 | gTTGAACTGCGTTAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGTCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTTCCGATTCCAGTGATGACGAt < 1:131318/251‑1 (MQ=255) tGAACTGCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCTTGTTGCCGATGCCAGTGGTGACGAT‑ct > 2:240909/1‑250 (MQ=255) gaccTGCTTGAAGTTTATTACCGTCAGCTTAGCCGGCAGCATCCTTAGTTTTACCTGCGTCATCGCGCCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTAGTTTGTGCCGCCGGATAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGTTCTGCGCTGTGTTGATGATGATTTCTACGCAAATTTTATCGCAGTTGCCCTTATTTTCCCTGTTCCCGATGCCAGTGATGGCGAT‑CAt < 2:458354/248‑1 (MQ=255) gCGTGAAGATTATTACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGACGAT‑CATGAt < 2:104125/249‑1 (MQ=255) 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attattACCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGAGCGACCAATGACGTCCATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGGGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTCCGCAAATTAGCTGGCCGTTGACCTTTTTTTCCCTGTTGACGATGCCAGTGAGGACGAT‑CATGATTAAGCGCAAc > 2:110904/1‑251 (MQ=255) attaCCGTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGACGAT‑CATGATTAAGCGCAACGGc > 1:395387/1‑251 (MQ=255) gTCAGCTAAGCCGGCAGCATCCTGAGTTTTACCTGCGTCATCGCACCGGTGACCTCATGGCTCGTGCGACCAATGACGTCGATCGC‑GTCGTGTTTGCCGCCGGAGAAGGGGTGCTGACGCTGGTGGATTCACTGGTGATGGGCTGCGCTGTGTTGATTATGATGTCTACGCAAATTAGCTGGCAGTTGACCTTATTTTCCCTGTTGCCGATGCCAGTGATGACGAT‑CATGATTAAGCGCAACGGCGATGCt < 2:252782/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |