| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,541,403 | G→A | D333N (GAC→AAC) | feoB → | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,541,403 | 0 | G | A | 97.0% | 196.9 / NA | 69 | D333N (GAC→AAC) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); major base A (27/38); minor base C (1/1); total (30/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTG > NC_000913/3541170‑3541649 | ccTGTGATGTTGTAAGCAACACCCTGACGGCGGACCCCTGCCTTTTCACCACTGCTGTAGATAAAATCCTGCTCAACCGTTTCTTCGGTCTGCTTATTTGCCTCTTTGTGAGGTACCTGATGTTCCTTCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTTTTTTACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGTACTTGCTACAC‑GATTC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTttcttc < 2:144734/250‑1 (MQ=255) gtgATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGTCTGACTATCTTCCta < 2:293063/251‑2 (MQ=255) gtgATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCtt < 1:160626/247‑1 (MQ=255) gATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGGCTTACAGCCGCCGTTTTTAGGCGGGTCCCAGGCG‑GTCTTTTTGCCTGGGATTCAATGGATTGGGTCCAC‑GCCCC‑ACTTCCCGAACTGGGTGACTATTTTCCTccc > 2:360650/1‑249 (MQ=255) gATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCg < 1:290237/250‑1 (MQ=255) gATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCg < 1:281246/250‑1 (MQ=255) aTGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGcc < 1:259704/251‑1 (MQ=255) gTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGGTACAGCCGCTGTTTTACAGCGGATCCCGGGCG‑CTATTTGTGCTTGGGATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACCTCCCGAACTGGCTGACCATCTTTCTCGTCCAggg > 1:163839/1‑251 (MQ=255) ccAACTCCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTg < 2:283083/250‑1 (MQ=255) cacCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTg < 1:388324/251‑1 (MQ=255) acCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGTGGTACCGGCCCTTATTTAAACCGGCGCCGTGTTG‑CTATTTGTTCTTGGGATTCAATGGATCGGCTACACTGCTC‑‑ACTTTCCGAACCGGCTGACTATTCTCCTCGCCCAGAGCCTgggcgg > 2:341440/1‑248 (MQ=255) acCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGGGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTTTGCATGGGATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCCGGGGCTgggggg > 1:337908/1‑248 (MQ=255) ggCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGGTACAGCCGCCGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CCATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTCCAC‑CCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACCATCTTCCTCACCCCGGGCCTGGGGGGCGGCAtt > 2:68355/1‑250 (MQ=255) gCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGCTTGACGTCCGCCCCGTGGGG‑CTATTTGTGCATTGTATTCAAAGGCTTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACCGGATGACTATCTTCCTCCCCCAGGGCCTggggggggggatta > 2:155354/1‑239 (MQ=255) cAGAACCCCGCCGTTTCGCCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTAAACCGTTTCCTCGGTCTTCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCT‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGGTTACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTTGGTGGCGGCATTAac < 1:343156/251‑1 (MQ=255) gAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTTACGTCGGCCCCGGGGCG‑CTATTTGGGCATGGTATTCAATGGGTTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGGGGCGGCATTAacac > 1:24659/1‑251 (MQ=255) cGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTCCAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGGATTTAATGGATTGGCTACCC‑GCCCC‑ACTTCCCCAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGGCCGGGGGGCGGGATTAAAACCGTGCTGcc > 2:322976/1‑251 (MQ=255) caccacTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTg < 2:57043/250‑1 (MQ=255) tGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTTTTTGTGCCTGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑CCTTCCCGAACTGGCTGACTATTTTCCTCGCCCCGGGCCTGGGTGGCGGCGTTAAAACCGTGCCGCCACTGGGGCCGc > 2:280896/1‑251 (MQ=255) gCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCAGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGGTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGGTACAGCCACGGGTTGACGTCGGGTCCGGGGCG‑CTATTTGGGAATGGGACTCAATGGGATGGGTAACC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCTTAGACCAAGGCATGGGTGGCGGCGTTTACACCGTGCTGCCCCTGGGGcccgc > 2:145038/1‑248 (MQ=255) gTAGATAAAATCGTGCTCAACCGATTACTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACACCCGCTGTTTGACGTCGGCCCCCTGGCG‑CCATTTGTACCTGGTATTTAATGGATTGGGAACAC‑GCTCC‑CCTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCCGGGACCCGGTGGCGGCGTTAAAAACGTGGTGCCACTCGTGccccncac > 2:380450/1‑245 (MQ=255) aGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATTGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTg < 1:375661/251‑1 (MQ=255) aGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGAtt < 1:322976/250‑1 (MQ=255) aTAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CCATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGTCGATATTCCTCGCCCCGGGCCTTGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCCCTGGGGCCGCAGAtttgg > 1:315302/1‑248 (MQ=255) aaCCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAACCGCTGTTTGACGCCGGCTCCGTGGCG‑CTTTTTGTGCATGGGATTCAATGGATTGGCTACAC‑CCTCC‑ACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCCCGCCCCGGGCCTGGGGGGGGGCATTAACACCGTGCTGCCACTTGTGCCGccgctttgcatggtttaccttgt > 2:129574/1‑229 (MQ=255) ccGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTcc < 1:415769/251‑1 (MQ=255) tCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGGGTTACATCCGCTGTTTGACGGCGGCTCCCTGGCG‑CCGTTTTTTCCGGGTATTCACTTGGTTGTCTTCAC‑GCTCC‑GCTTTCCGAACTGGGTGGCTATCTGTCTCTCCCCAGGCCTCGGTGGCGGCCTTAACACCCAGCTTCCCCTGGTGCCCCCGATTGGCATGGTGTACCCTTTTCTCtccttc > 2:285525/1‑251 (MQ=255) gTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTTACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGGATTCAAAGGGTTGGCTTCAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGGCTATCTTCCTCGCCCCGGGCCTGGGTGGGGGCATTTACACCGTGCCTCCACCGGGTCCGCAGATTGGCGTGATGTACCCGTTCCTCCccctcctt > 2:155050/1‑251 (MQ=255) ccgctTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGt < 2:94286/248‑1 (MQ=255) ctTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACATCCGCTGTTTGACGTCTGCTCCCAGGCGATTTTTTGGGC‑TGGTATTTCATGGATTGGCTTAAC‑GCTCCCACT‑CCCCGCCTGGCTGACTTTCTTCCTCGCCCCCGGCCTGGGGGGGGGCATTCACCCCGTGCTTCCCCTGGGACCGCCGATTGGCATGCTGTACCTGTACCCCTCCTTCCTTGGTGGCTCCGGGtat > 2:222033/1‑250 (MQ=255) tgATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACCTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAAAACCGTGCTGCCCCTGGGGCCGCCGATTGGCATGATGTACCCGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGGATATTgcg > 1:318117/1‑251 (MQ=255) gTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGCGGCG‑CTCTTTTTGCATCGGATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑CCTTCCCGAACTGGCTGGCTATCTTCCTCCCCCACGGCCTGGGCGGCGGCATTAACCCCGTGCTGCCAATGGTGCCGCAGGTTGGCATGATGTAACTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTACgggggtatggggtgtg > 1:71468/1‑238 (MQ=255) tACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTTCAGCCGCTGTTTTACGTCGGCCCCGTGGCG‑CCATTTGTGCCTGGTATTCAATGGATTTGCTACAC‑CCTCC‑ACTTCCCGCACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGTGCCTGGGTGGCGGCCCTAACACCCTTCTGCCTCTGGTGCCGCAGATTGGCCTGATTTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTTAGGACTCCGGGCATTTGGCGCGTgg > 1:71698/1‑250 (MQ=255) tACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGAGTTAAAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTTTGCATGGTATTCAATGGATTGGGTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCCATGGGGCCGCAGAGTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTTAGGAATCCGGGGATATGGCGAGTgc > 1:325321/1‑251 (MQ=255) aCCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGTCGCGTgc < 1:324531/250‑1 (MQ=255) ccTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcgg < 1:88902/251‑1 (MQ=255) gATGTTCCTGCTGGCTTGCAACATCGGCGGGGCGTTCCATCCGCTGTTTGACGTCGGCCCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACACCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGt < 2:415317/251‑1 (MQ=255) gATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTgcggc < 1:115015/249‑1 (MQ=255) gATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGGCGGCTCCGTGGGG‑GTATTTGTGCAAGGTATTCAATGGATTGGGTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGTCTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTTGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCATTGAGGAGTCCGGGTATATGGGGCGGgcggcgg > 1:365493/1‑250 (MQ=255) gTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGtt < 2:215795/249‑1 (MQ=255) tCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTtgt < 1:30105/250‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGa < 1:405601/251‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTATCAACATCGGCGGCGAGTTACTGCCGCTGTTTGACGTCGTCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATTGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTTCCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTAGATGGCGCGTGCGGCGTTtgtg < 2:405423/250‑1 (MQ=255) gctgGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTTACGTCGGCTCCGTTGCG‑CTATTTTTGCATGGTATTTAATGGATTTGCTACCC‑GCTCC‑CCTTTCCGAACTGGCTTACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTTGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGGTTGTGATgg > 1:348461/1‑251 (MQ=255) tgGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCCGGGCG‑CCATTTGTGCAAGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑CCCCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGGGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGGGCCGCAGATTGGCCTGATGTAACTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGGATATGGTGCGTGGGGCGTTTGTGATggcc > 1:258445/1‑249 (MQ=255) cAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTg < 2:286824/250‑1 (MQ=255) aaCATCGGCGGGGGGTTACAGACGCTTTTTTACGTCGGCCCCCTGGCG‑ATATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGGCTATTTTTCTCGCCCCGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCCTGCTGCCCCTGGGGCCGCATATTGGCCTGAAGTAACTGTTCCTTTCCTTCCTTGATGACTTCGGGTATATGGCGCGGGCGGCGTTTGTGATGGagcgcctgct > 2:278258/1‑242 (MQ=255) gcggGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGgcg > 1:65318/1‑251 (MQ=255) gtggCGTTACAGCCGCTTTTTGACGTCGGCTCCGGGGCG‑CTATTGGTGGATGGTATTCAATGGATTGGCTACTC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTGCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGTCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGATGCAGAGTGTCAGGATGTTCTTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTACGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGGCCGTCTGAttgaggagct < 2:45817/249‑10 (MQ=255) gTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCt < 1:38352/251‑1 (MQ=255) tACAGCCGCGGTTTGACTTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACGCCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGGGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCtt < 2:198090/250‑1 (MQ=255) ccGCTGTTTGACGTCAGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCCTGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCggg > 1:117703/1‑251 (MQ=255) gTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGaaa < 1:313352/250‑1 (MQ=255) ttGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATc < 2:348461/250‑1 (MQ=255) gCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCCCC‑ACGTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGTAAATCCTTTGTGCCg < 2:292205/251‑1 (MQ=255) ggCG‑CTATTTGTGCCTGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑CCTTCCCGAACTTGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTTCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGAtc < 2:254121/250‑1 (MQ=255) gcg‑cTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGAtcgt < 1:278258/251‑1 (MQ=255) tgtgCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGtcggtttc < 1:274252/250‑1 (MQ=255) tgtgCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGtcggtttc < 1:395501/250‑1 (MQ=255) gtgCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTTGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGtcggtttcgg < 2:125292/251‑1 (MQ=255) gtgCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGtcggtttcgg > 1:128795/1‑251 (MQ=255) cAATGGATTGGCTACAT‑GCTCC‑ACTTCCCGCACTGGCTTGGTTTCTTCCGTGCCCAGGGCCTTGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTGGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGGTGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGAGCGTCGGTTTCGGTTgtaccgtacc < 2:44889/251‑1 (MQ=255) cac‑GCTCC‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTCCCGTCGGTAATGGGTg > 1:151722/1‑251 (MQ=255) cc‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGATGCaagt > 1:237435/1‑247 (MQ=255) ccgcTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGt < 2:262298/247‑1 (MQ=255) c‑ACTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACCCCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTAc < 2:90765/251‑1 (MQ=255) aCTTCCCGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACg < 1:280896/251‑1 (MQ=255) tCCCGAACTGGCTGACTATCTTCATCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCCTGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCtt > 2:18281/1‑251 (MQ=255) cccGAACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTg < 1:129574/251‑1 (MQ=255) | TCTGTGATGTGGTAAGCAACACCCTGACGGCAGAACCCAGCCGTTTCACCACTGCGGTAGATAAAATCGTGCTCAACCGTTTCCTCGGTCTGCCGATTTTCCTCTTTGTGATGTACCTGATGTTCCTGCTGGCTATCAACATCGGCGGGGCGTTACAGCCGCTGTTTGACGTCGGCTCCGTGGCG‑CTATTTGTGCATGGTATTCAATGGATTGGCTACAC‑GCTCC‑ACTTCCCGGACTGGCTGACTATCTTCCTCGCCCAGGGCCTGGGTGGCGGCATTAACACCGTGCTGCCACTGGTGCCGCAGATTGGCATGATGTACCTGTTCCTCTCCTTCCTTGAGGACTCCGGGTATATGGCGCGTGCGGCGTTTGTGATGGACCGTCTGATGCAGGCGCTGGGCTTGCCGGGGAAATCCTTTGTGCCGCTGATCGTCGGTTTCGGTTGTAACGTACCGTCGGTAATGGGTGCACGTACGCTTG > NC_000913/3541170‑3541649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |