| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 568,449 | IS2 (–) +5 bp | coding (135‑139/333 nt) | emrE → | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 568449 = | 0 (0.000) | 14 (0.640) | 13/490 | 0.6 | 100% | coding (135/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 568453 | 0 (0.000) | 17 (0.790) | 16/488 | 0.4 | 100% | coding (139/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAG > NC_000913/568216‑568680 | gaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCt > 1:202842‑M1/234‑251 (MQ=255) aaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtcttgagatgcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTg > 1:82596‑M1/233‑251 (MQ=255) aaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTg > 1:223488‑M1/233‑251 (MQ=255) aaaGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatattt > 2:149355‑M1/1‑232 (MQ=255) aGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttcc > 1:77375‑M1/1‑230 (MQ=255) tggctgctaaaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTcc < 2:30421‑M1/30‑1 (MQ=255) tgctacaccatgttgccgggcaacgagggcgaccggcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattacgactatcacttatttaagtgatcttggtggtctggagattcaggtggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGATTATATTCCTAc < 2:9538‑M1/33‑1 (MQ=255) ggAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgtta < 2:150428‑M1/251‑34 (MQ=255) tgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCtt < 1:110727‑M1/44‑1 (MQ=255) aaCAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 2:77375‑M1/251‑49 (MQ=255) aaCAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 2:48796‑M1/251‑49 (MQ=255) catccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtaagccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattgtttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGTTCAGGATTCGGTAtt > 2:207804‑M1/182‑251 (MQ=255) ccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCt > 2:191986‑M1/177‑251 (MQ=255) caaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggtcctaagacatcaatcatctgttctccaatgtctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccggtctaGTGATTTGCTCAGACGCTGTCTTATATTCCGACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTa > 1:98724‑M1/171‑250 (MQ=255) ctcCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc < 1:190531‑M1/249‑83 (MQ=255) tttGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATCTTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGATATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagccagctgccgcacatattcccgtggcgaacgataaccc > 2:189923‑M1/1‑161 (MQ=255) acgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCt > 1:92093‑M1/131‑250 (MQ=255) atatTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataat < 2:123121‑M1/250‑122 (MQ=255) aTCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagccatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcga > 2:1733‑M1/1‑123 (MQ=255) tctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggtggtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAg > 1:217876‑M1/117‑250 (MQ=255) aaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCa > 2:167131‑M1/71‑251 (MQ=255) gTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcggtaacccagctcactatgcggatg < 2:105707‑M1/170‑108 (MQ=255) gTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatg > 1:105707‑M1/1‑63 (MQ=255) aagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCAcacca > 2:73011‑M1/58‑250 (MQ=255) gactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACAt < 1:81618‑M1/196‑1 (MQ=255) acacGGATATGGCCATCTGTTGGCACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgcgattcgttataatgatcgaacgcctctgcaaggtgctttgctgccgttaacacgtctggtttgggcatgatactgatgtaggcac > 2:185209‑M1/1‑58 (MQ=255) ggCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcg < 1:71470‑M1/250‑203 (MQ=255) ccanttgttggTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgtgcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaaccctgctggtttgggcatgatactgatgtagtctcgttttatcgttt < 2:206964‑M1/246‑206 (MQ=255) tattTGTTATTGTGCAGCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgc < 1:1733‑M1/250‑222 (MQ=255) tttGATATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctat > 2:36504‑M1/1‑27 (MQ=255) gTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattcc > 1:73611‑M1/1‑24 (MQ=255) | TATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAG > NC_000913/568216‑568680 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |