| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,388,510 | C→T | intergenic (‑84/‑125) | yfbN ← / → yfbO | uncharacterized protein YfbN/uncharacterized protein YfbO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,388,510 | 0 | C | T | 92.9% | 41.1 / ‑5.7 | 14 | intergenic (‑84/‑125) | yfbN/yfbO | uncharacterized protein YfbN/uncharacterized protein YfbO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (6/7); total (6/8) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGTCAATATGAAACAACTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATC > NC_000913/2388299‑2388748 | tGGTCAATATGAAACAACTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACtaata > 1:181532/1‑250 (MQ=255) atatTAAACAACTTGATGGTTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTa < 1:167623/251‑1 (MQ=255) caACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTat > 2:272155/1‑200 (MQ=255) gTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGa > 1:145320/1‑250 (MQ=255) aaCCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATAATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGt < 1:230099/251‑1 (MQ=255) tCNATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTTGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAata < 2:256172/250‑1 (MQ=255) ccATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATAGTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAAGAATACGTATGGAATTGTCTCTATTTATCTGCTAATGAAGTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGTGAATAATTATGACACCTTGAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATc < 2:30737/251‑1 (MQ=255) ttAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaata < 1:46860/178‑1 (MQ=255) ttAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaata > 2:46860/1‑178 (MQ=255) tataACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAatata < 1:58667/158‑1 (MQ=255) tataACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAatata > 2:58667/1‑158 (MQ=255) aCCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTAGCTGCTAATGAATTCAATCAATGTCAATCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGGGATGTTAATAAGCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCGCGTGAGGAtttt < 2:157119/251‑1 (MQ=255) ccTGACTGAATATCGCACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCTCTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATTAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATGGTTATCTCTTGATGATTTTTTTAtt < 2:11984/251‑1 (MQ=255) tctcACGTTTTCTTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATc > 2:86064/1‑251 (MQ=255) | TGGTCAATATGAAACAACTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATC > NC_000913/2388299‑2388748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |