| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 568,449 | IS2 (–) +5 bp | coding (135‑139/333 nt) | emrE → | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 568449 = | 0 (0.000) | 25 (0.680) | 24/492 | 0.6 | 100% | coding (135/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 568453 | 0 (0.000) | 33 (0.900) | 29/490 | 0.4 | 100% | coding (139/333 nt) | emrE | multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGA > NC_000913/568204‑568698 | gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgatggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtatgaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGttat > 2:62270‑M1/246‑250 (MQ=255) aTTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtgga < 2:208033‑M1/250‑5 (MQ=255) aactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtgcgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttattgaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATAAGCTCAGACGCTGGCtt > 2:182812‑M1/229‑251 (MQ=255) aaaGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatattt > 2:49374‑M1/1‑232 (MQ=255) ggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTtata > 1:81215‑M1/225‑250 (MQ=255) gctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagagtcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTa > 2:175908‑M1/220‑251 (MQ=255) tacaccatgttgccgggcaacgcgggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAggg < 2:171634‑M1/37‑1 (MQ=255) acaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactatcctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggcgattctgggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACagggg < 2:325181‑M1/38‑2 (MQ=255) acaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttattgaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAgg > 2:191035‑M1/214‑249 (MQ=255) ccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCt > 2:149227‑M1/203‑251 (MQ=255) aaaacAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTCTCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATGGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat > 2:77108‑M1/2‑205 (MQ=255) gcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatctcttatttaagtgatattggttgtctggtgattcaggtgggcagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGTATGGGTTATGTTATCt > 2:22518‑M1/199‑251 (MQ=255) agttCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgcc > 1:620‑M1/1‑190 (MQ=255) aCAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGCAAGAATATGCTATGCACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctctatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg > 2:64702‑M1/1‑175 (MQ=255) ctctccctttttcacaggaaagaatatGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTAAATTAGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatcttttctaacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagc > 1:162912‑M1/14‑169 (MQ=255) ccAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg < 2:199264‑M1/248‑84 (MQ=255) aGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataac < 1:311856‑M1/251‑89 (MQ=255) aaCAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatcttcccgtggcgagcgataacccagcg > 1:220640‑M1/1‑157 (MQ=255) cgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGAttttt < 1:158115‑M1/102‑1 (MQ=255) aaaGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat > 1:213838‑M1/1‑151 (MQ=255) ttcctgtgtggcccgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCa < 1:279853‑M1/108‑1 (MQ=255) gtacgccgtctacgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccactgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGAcc < 2:246744‑M1/119‑1 (MQ=255) cccTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGACATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGACATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgtt > 1:168931‑M1/1‑134 (MQ=255) gtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTgccagc < 1:287027‑M1/126‑1 (MQ=255) atTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgct < 2:50787‑M1/251‑125 (MQ=255) tttATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTAGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGTCTTTACAAGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctc > 2:41583‑M1/1‑126 (MQ=255) aTCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTCCAGAAGGATTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCCTTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcga > 1:25474‑M1/1‑123 (MQ=255) tctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCattatgg > 1:349427‑M1/117‑248 (MQ=255) ggTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaac < 2:55814‑M1/250‑160 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGatt < 1:354736‑M1/166‑1 (MQ=255) aattactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGattatt < 1:189954‑M1/169‑1 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactagcacttatgtaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcgaGTTATGAGCTGAGAGGCGGGCTTATATTCCTACAGGGAGTGCTTAGGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGGCATGGGGATTTGTGGGCGAACGGGTGGACCTGGCAGGCAGTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGAttatta > 1:31148‑M1/82‑251 (MQ=255) aaTGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggttt < 1:337713‑M1/250‑171 (MQ=255) ttCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgat < 2:370369‑M1/250‑180 (MQ=255) ttCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatagttccagacagctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgatagcccagcgcgctatgcggatgccatgcgttataatgcttgatcgcctctgcaagtttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgat < 1:42608‑M1/250‑180 (MQ=255) cAGAAGGTTTTACCCTGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTTTTTGTTTTTTTGCATCATTCTTGTTATtggatttgcccctatatttcccgacatctgttatcccttaacccattacaagcccgctggcgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattctttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatac < 1:263728‑M1/250‑182 (MQ=255) cAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatact > 1:349376‑M1/1‑69 (MQ=255) agtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGc < 2:247546‑M1/187‑1 (MQ=255) ggTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgt > 1:72482‑M1/1‑64 (MQ=255) ttACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTCTTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtc > 1:47266‑M1/1‑60 (MQ=255) acGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccatcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgc < 1:152543‑M1/251‑196 (MQ=255) ggTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctt > 1:205573‑M1/1‑54 (MQ=255) tATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTAGTGTGCATCATTCTGGTTATgggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgcttta < 2:304266‑M1/250‑200 (MQ=255) tatgtaagtgatagtggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTTCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAaataa > 1:224142‑M1/46‑249 (MQ=255) ccATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtcgggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttt < 1:134783‑M1/251‑206 (MQ=255) ggTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagc > 1:99630‑M1/1‑37 (MQ=255) cAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctc > 2:19882‑M1/1‑33 (MQ=255) gtctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTaaa < 2:40696‑M1/224‑1 (MQ=255) ctggagattcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAat < 1:66662‑M1/226‑1 (MQ=255) tttGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctat > 1:320126‑M1/1‑27 (MQ=255) gTTATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaactcgtctggtgtgggcaggatactgatgtagtctcgcgttagtgttttcacgaagctctctgctattc < 2:353552‑M1/250‑227 (MQ=255) tATTGTGCATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgt > 1:85889‑M1/1‑22 (MQ=255) tATTGTGAATCATTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgt > 1:214680‑M1/1‑22 (MQ=255) tcagggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGc > 2:203249‑M1/17‑250 (MQ=255) ggggccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCtta > 2:181324‑M1/13‑251 (MQ=255) tcatTCTGGTTATtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccatccgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccg > 2:267026‑M1/1‑13 (MQ=255) ccagtctaGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCttatatt > 1:122114‑M1/9‑251 (MQ=255) aGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGa > 2:321979‑M1/2‑251 (MQ=255) | GGGTATTGAGGGTATATAAAAGAACATCAATGGGAACACAATGATGAAACAGGTGAGTTGAGTTCAAACTGTAGTACAATTCTCTCCAGTTTGAACAGGAAAGAATATGCTATGAACCCTTATATTTATCTTGGTGGTGCAATACTTGCAGAGGTCATTGGTACAACCTTAATGAAGTTTTCAGAAGGTTTTACACGGTTATGGCCATCTGTTGGTACAATTATTTGTTATTGTGCATCATTCTGGTTATTAGCTCAGACGCTGGCTTATATTCCTACAGGGATTGCTTATGCTATCTGGTCAGGAGTCGGTATTGTCCTGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGCATGATGTTGATTTGTGCCGGTGTGTTGATTATTAATTTATTGTCACGAAGCACACCACATTAAAATAATTTGTTTCTAAACGACTAAAATATGGAGGCTCTTATATTTATATGA > NC_000913/568204‑568698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |