| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 57,276 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑167/‑84) | lptD ← / → djlA | lipopolysaccharide assembly protein LptD/co‑chaperone protein DjlA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 57280 | 0 (0.000) | 49 (1.330) | 46/492 | 0.0 | 100% | intergenic (‑171/‑84) | lptD/djlA | lipopolysaccharide assembly protein LptD/co‑chaperone protein DjlA |
| ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
TGCCAGTCCCTGTTGACTATAAAGGGCGGTGGCAATCATGGTGGCCAGGAGAGTGGGGATACGTTTTTTCATACGTTGATTTTATTGTTCCATCATCGGTAACGTTGCGCGTGACAAACGGTCAGAGACTAACGTACTCGTCATCTCTACGCTAGTGTTAATCCTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAATTATAGGCGATGTCCCACAATTGACCGCAGCCGGAAAACGGTAAAAGCACCTTTATATTGTGGGAGATAGCCCTGATATCCGTGTGTCGATTTGGGGAATATATGCAGTATTGGGGAAAAATCATTGGCGTGGCCGTGGCCTTACTGATGGGCGGCGGCTTTTGGGGCGTAGTGTTAGGCCTGTTAATTGGCCATATGTTTGATAAAGCCCGTAGCCGTAAAATGGCGTGGTTCGCCAACCAGCGTGAGCGTCAGGCGCTGTTTTTTG > NC_000913/57038‑57529 | tGCCAGTCCCTGTTGACTATAAAGGGCGGTGGCAATCATGGTGGCCAGGAGAGTGGGGATACGTTTTTTCATACGTTGATTTTATTGTTCCATCATCGGTAACGTTGCGCGTGACAAACGGTCAGAGACTAACGTACTCGTCATCTCTACGCTAGTGTTAATCCTGTCCGAATAGCGTCAGTGGTGTTAGGCACGGCATTGAATGACAGGTATGATAATGCAAATTATAGGCGATGTCCCACAtagactgg > 2:30799‑M1/1‑243 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |