| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,680,659 | T→C | V368A (GTG→GCG) | ydgI → | putative arginine:ornithine antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,680,659 | 0 | T | C | 100.0% | 165.6 / NA | 48 | V368A (GTG→GCG) | ydgI | putative arginine:ornithine antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (26/22); total (26/22) | |||||||||||
GGTTTGATCGTTTCCGTTTGCGGCGCGTACTTAAGCTGGACCATCATGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGTGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTG > NC_000913/1680418‑1680904 | ggTTTGATCGTTTCCGTTTGCGGCGCGTACTTAAGCTGGACCATCATGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTAttt > 1:341230/1‑251 (MQ=255) 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tGGACCATCATGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAACTCGCACCCCg > 2:410222/1‑251 (MQ=255) tGGACCATCATGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCg > 1:196664/1‑251 (MQ=255) catGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGc < 1:395998/251‑1 (MQ=255) 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cgcCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTTGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACTCGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATTGTTATTGTACGCCTCTGGTcc < 2:191055/251‑1 (MQ=255) ccAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCa > 1:111426/1‑250 (MQ=255) agatcGCACAAGCTGGGCCATCCGCCTCACTGTGGTTTACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCTCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCTCTGCAGAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATg < 2:371987/247‑1 (MQ=255) acaAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGc < 1:154034/245‑1 (MQ=255) acaAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGc > 2:154034/1‑245 (MQ=255) acaAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGCGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGc > 1:257388/1‑251 (MQ=255) 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GGTTTGATCGTTTCCGTTTGCGGCGCGTACTTAAGCTGGACCATCATGGCAGCAGAAGTACCGTTCCTGGCCGCCACTCATAAAGCATTCCCGCGCATTTTTGCGCGCCAGAACGCACAAGCTGCGCCATCCGCCTCACTGTGGTTGACCAACATCTGCGTGCAAATTTGTCTGGTACTCATCTGGCTGACCGGTTCCGATTACAACACGTTGCTGACCATCGCCTCAGAAATGATTCTGGTGCCCTATTTCCTGGTCGGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTG > NC_000913/1680418‑1680904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |