| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 615,848 | G→A | P564P (CCG→CCA) | entF → | apo‑serine activating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 615,848 | 0 | G | A | 97.6% | 135.8 / NA | 42 | P564P (CCG→CCA) | entF | apo‑serine activating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (20/21); minor base C (0/1); total (20/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTG > NC_000913/615616‑616090 | gcgAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAAGCGGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTGCCGCGCTCGGGCTTTTTGTCCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGTTATCCGGGTGATCGCGTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTGTATTACCATCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTccc < 1:252371/251‑1 (MQ=255) ggtagtggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTaa < 2:52462/247‑1 (MQ=255) ggtggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACaa < 2:186107/251‑1 (MQ=255) aaTCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATaa < 2:314831/251‑1 (MQ=255) tGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGCCGCTGTTAATTACCACCGTCGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAAAAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCtt > 1:109221/1‑250 (MQ=255) aaaCCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGc > 2:105820/1‑249 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGGTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCa < 1:61238/251‑1 (MQ=255) cGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTc > 1:60145/1‑250 (MQ=255) gCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAAcc < 1:185057/251‑1 (MQ=255) cgcgCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTAAACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcac > 2:95945/1‑251 (MQ=255) ggTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTcc > 2:80703/1‑165 (MQ=255) ggTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTcc < 1:80703/165‑1 (MQ=255) ggTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCtt > 1:135281/1‑251 (MQ=255) gCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACctc > 1:139120/1‑251 (MQ=255) 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gAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGcc < 2:135281/251‑1 (MQ=255) gCTGCAGCGGCCGGGATACCGCGGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTTCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCGGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCCGCAGGCC‑Gaa < 2:106847/251‑1 (MQ=255) atcccGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATTCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAATGTGTAATGGTCGGGCAGACGGCt < 2:350283/248‑1 (MQ=255) gCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTc > 1:283610/1‑251 (MQ=255) cGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGc > 2:393755/1‑251 (MQ=255) aCGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTGTACCTCTGGCTCCCCCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTg < 2:202623/251‑1 (MQ=255) tCGCCTGAAAATGATGCTGGCAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTg > 1:346728/1‑134 (MQ=255) 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ggatgCTGGAAAATGCGCGTCCGTCGTTGTAAATTACCCCCGACGATCACCTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACCCCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTCCCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAAt < 2:284912/250‑1 (MQ=255) gatgCTGTAAGATGCGCGTCCTTCGCTTTTAATTACCCCCGATGACCACATGCCCCGCTTTGGCGATGTTCCCAATTAAACAAGCTTCTGCTTTACCGCCCCGCTTACACCGCAGGGTCGGGAGCCGCTGCATCTTTCACACCCGCATCCCACGGCTCATACCATCTTCCCCCCTGCCTCCACCGG‑AGGCCCGAAAGGGGTAAGGGTCGGGCAGTCGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATc < 2:11807/251‑1 (MQ=255) atgCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATc > 1:8319/1‑250 (MQ=255) 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tACCACCGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGcc < 1:105820/250‑1 (MQ=255) caccGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATACCGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCg > 1:408491/1‑109 (MQ=255) caccGACGATCAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCGATAACGCCCCGCTTACACCTCAGGGCAGTGCGGCGCGGCAACTTTCACAACCg < 2:408491/109‑1 (MQ=255) cAACTGCCACGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTg > 1:390003/1‑251 (MQ=255) | GCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGCAGGCC‑GAAAGGGGTAATGGTCGGGCAGACGGCTATCGTCAACCGCCTGCTTTGGATGCAAAATCATTATCCGCTTACAGGCGAAGATGTCGTTGCCCAAAAAACGCCGTG > NC_000913/615616‑616090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |