| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,681,097 | A→G | Y41C (TAT→TGT) | folM → | dihydromonapterin reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,681,097 | 0 | A | G | 98.8% | 301.7 / NA | 82 | Y41C (TAT→TGT) | folM | dihydromonapterin reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (39/42); minor base T (0/1); total (39/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTATCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGGTGTGATGGCGTTTGCCGATGAAGTACTAAAAAGCACCCATGGTCTGCGTGCTATTTTGCATAACGCCAGTGCGTGGATGGCGGAAAAACCGGGTGCGCCACTGGCCGACGTACTGGCTTGCATGATGCAGATCCACGTTAATACCCCATACCTGCTCAACCATGCGCTGGAAAGATTACTGCGTGGGCACGGACACGCCGCCAGCGATATCATTCACTTTACCGA > NC_000913/1680801‑1681391 | gTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACNCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGNTGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTcc > 2:645515/1‑300 (MQ=255)gTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGTCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTAGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTcc > 2:290169/1‑300 (MQ=255)gTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTcc > 2:86202/1‑300 (MQ=255) tGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGc < 1:226033/300‑1 (MQ=255) cACCTGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACTCATGATAAGGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAAGTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAGAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGgccagcca < 2:693684/300‑1 (MQ=255) cACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCa < 1:17162/300‑1 (MQ=255) cACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCa > 2:506715/1‑300 (MQ=255) cACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGGCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATNTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGcaa > 2:665385/1‑298 (MQ=255) gtgctgctGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCACGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGAt < 2:543924/298‑1 (MQ=255) tgctgGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGAc < 2:561267/300‑1 (MQ=255) 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cGCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTc < 1:159684/300‑1 (MQ=255) gCATACCCATGATAATGTACTGAACCGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCa < 1:322921/300‑1 (MQ=255) aCCCATGATAATGTACTGAAACGTCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTATTAATTGCCTAAGTTCCGGCGAACTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTACAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGCGTATTCAgact > 2:357753/1‑297 (MQ=255) 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tCAGGAAATGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGGCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGgtgt < 1:686661/300‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGATTGGCATGCTGTTAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGGTGTGATGGCg < 1:426656/300‑1 (MQ=255) ttAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGTAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGGTGTGATGGCGTTTGCCGATGAAGTACTaaaa < 1:893995/300‑1 (MQ=255) ttAATTGCCTCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGGTGTGATGGCGTTTGCCGATGAAGTACTaaaa < 1:807109/300‑1 (MQ=255) catCAGTTCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGCCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTCAGGCTGATTTTTCGACCAACGACGGTGTGATGGCGTTTGCCGATGAAGTACTAAAAAGCAccc > 2:51221/3‑300 (MQ=255) ttCCGGCGACCTGGATGCTGGTGGGATAACGTTCATCCCATCGTTGGATAGCAAAGGAGATAACGATGGGTAAAACCCAGTCCTTGCCAATATTAATTACTGGCGGAGGTCGTCGCATCGGCCTCGCCCTCGCATGGCATTTCATTAATCAAAAGCAACCGGTGATTGTCAGCTATCGGACACACTGTCCAGCCATTGATGGACTGATTAATGCAGGTGCGCAGTGTATTTAGGCTGATTTTTCTACCAACTACGGTGTGATGGCGTTTGCCGATGAAGTACTAAAAAGCACCCATGGTc < 2:118080/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |