| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,449,312 | G→A | T191I (ACC→ATC) | rpsC ← | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,449,312 | 0 | G | A | 98.9% | 330.7 / NA | 91 | T191I (ACC→ATC) | rpsC | 30S ribosomal subunit protein S3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (35/55); minor base C (1/0); total (36/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCTGCTTCGATCTGACGGGCAGTCAGACGACCACGGCCAACAGCTTTCAGACCGAAGCTGCCGAAGCTAACATCCGTACCCTGCGCCAGACCGCGGTTACGGCCTTTGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGGTGTGCGCTTCAGAGGTGTTGTAGTCGATGTCAGCACGCAGAGTGTGCAGCGGTACGCGACCTTCGCGGTACCATTCGGTACGTGCGATTTCCGCGCCGCCCAGACGGCCGCTAACTTCAACTTTAATACCTTTAGCGCCCAGACGCATTGCGTTCTGTACAGCACGCTTCATAGCACGACGGAACATAACGCGACGTTCCAGCTGAGAAGTGATGCTGTCAGCAACCAGTTTTGCGTCCAGTTCAGGCTTACGAACTTCGGCGATGTTGATCTGTGCAGGAACGCCAG > NC_000913/3449022‑3449600 | gTGCTGCTTCGATCTGACGGGCAGTCAGACGACCACGGCCAACAGCTTTCAGACCGAAGCTGCCGAAGCTAACATCCGTACCCTGCGCCAGACCGCGGTTACGGCCTTTGTGCATTTTACGGAATTTTGTACGCTTTGGTTGTAACATCAGCGACGCTCCTTATTTACGGCCTTTACGCTGCTGCTTTTTAGGCTGAGCAGCCGGTTTTTCCGGTTGTTCAACAGCAGCCATACCACCCAGGATCTCGCCTTTGAAGATCCACACTTTAACGCCGATTACACCGTAAGTGATGTGCGCtt > 2:504176/1‑300 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |