| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3469040 | 101 (0.910) | 6 (0.060) | 5/558 | 9.0 | 5.2% | coding (814/2694 nt) | chiA | endochitinase |
| ? | NC_000913 | 3469344 = | 126 (1.210) | coding (510/2694 nt) | chiA | endochitinase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACATAACGC > NC_000913/3468741‑3469335 | ccGTGGGCAATCTTTATACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGTCCGCTCCACGCTTGCAAGGAGTAATCGTTAACGCTATTCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGtt < 2:860369/300‑1 (MQ=255) gggCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTg < 1:68816/300‑1 (MQ=255) aTCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACAGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTATTGGTATc > 2:363684/1‑300 (MQ=255) cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTACACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTAACTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGt > 2:679578/1‑300 (MQ=255) cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGNTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGNCCTCGt > 2:747722/1‑300 (MQ=255) cTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGt > 1:33711/1‑300 (MQ=255) cccaacccaCCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATTGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGTGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTtttcttt < 2:229037/300‑1 (MQ=255) cGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGc < 1:882508/300‑1 (MQ=255) cTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTNGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGANCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCAATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAAtt > 2:617402/1‑300 (MQ=255) ttGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAAttt < 2:683359/300‑1 (MQ=255) ttGTAAACACTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAAttt < 1:423653/300‑1 (MQ=255) aCATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCcgcg > 1:426431/1‑300 (MQ=255) ccATTGAAAATAACATGGTCAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCACTGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACAGAACAGGAGCCAAGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCAGTTGCCGCGCGCACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTAcc > 2:248742/1‑300 (MQ=255) cATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCACTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTAccc < 2:188221/300‑1 (MQ=255) aTTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGNGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCAACGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGNGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTAcccc > 2:835030/1‑299 (MQ=255) gaacaTAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGNCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTTTTTCGCATCGCCTGGGCAACTTGCAGCGCCTACccacca > 2:213271/5‑300 (MQ=255) aTAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCGATTAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGTTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCTGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCANCCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCg < 2:211236/300‑1 (MQ=255) aTAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCg < 1:177689/300‑1 (MQ=255) atgttAAATTTCGCTACCTTCCTGTCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGTTGTTGATTGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCAAAGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCtt < 2:3175/296‑1 (MQ=255) 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cATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTAATGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCAc > 2:679879/1‑300 (MQ=255) tAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCAGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCAcaa > 1:522739/1‑298 (MQ=255) gCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCNGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACAt > 1:621070/1‑300 (MQ=255) gCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACAt < 1:548544/300‑1 (MQ=255) ggggtACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCATGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTGCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACATAACGc < 2:449249/296‑1 (MQ=255) gggTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACATAACGc < 1:23333/300‑1 (MQ=255) | CCGTGGGCAATCTTTAGACCCAACCCACCAGGCGTTCTTGTAAACATTACCATTGAAAATAACATGGTAAATTTCGCTACCTTCCTGGCCGCTCCACGCTTGCAATGAGTAATCGTTAACGCTATCCGCTGGTGTTGATGGCTCGCTGTTATCCGGAGTTGGGGTCACCGGTGTTTCCGGAGTTGGATCAACCGGAGTCACAGCACCGCCATTATTATCCGGCTTAACGGAACAGGAGCCAGGGTTACCATACTGGCTGATTTCTGTTGCCGTTGCCGCGCGAACATAACGCCATGGGTTACTGGCATCGTTTTCTTTCGCATCGCCTGGGCAATTTGCCGCGCCTACCCACCAGGCGTTCTTATAAATGCCGCCGTTATAGATAACGTACCATGTAGAAGAACCTTCCTGACCTTTCCAGGCTACTACAGCATAGTTGTCGTTTGACTTATCAGCTGGGGCTGGCTGAACATCAGGAGCCGGTTTAACGTCCGGTGCCGGTTTCACATCCGGTGAAGGCTGTGGTGCTGAAGTACAGGACTGTGGATTACTGGTTTCTGAGATTTCCGTTGCCGTAGCGGCACGAACATAACGC > NC_000913/3468741‑3469335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |