| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1286906 | 69 (0.620) | 8 (0.080) | 6/558 | 8.5 | 10.7% | coding (198/276 nt) | ychS | putative uncharacterized protein YchS |
| ? | NC_000913 | 1287557 = | 69 (0.660) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTA > NC_000913/1286607‑1287202 | cgcttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAtt > 1:411772/1‑300 (MQ=255) tATCCGACCTACATGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAG‑TTCA‑GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:715609/300‑1 (MQ=17) tATCCGACCTACAGGGGGGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGGTGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAG‑TTCA‑GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 2:28994/300‑1 (MQ=18) tATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc < 1:529734/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGTAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑gcgc < 1:77826/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGTAAGCGATGGTGGTGGGGTAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑gcgc < 1:121816/300‑1 (MQ=255) gACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑gcgc < 1:576905/300‑1 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcaacccctcgac > 1:559962/1‑288 (MQ=255) cTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCA‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTgc > 1:12534/1‑300 (MQ=255) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACNGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCACCGCATGGGCAGAATATTTACTTGCGGCTTAGTT‑GGGAA‑GTCCAGGGNCTCTTGCAAATGATTGCGGTGGGGGAAGGAttcgaacattcgaagtcgctaacg > 2:822088/1‑278 (MQ=17) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACNGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGACCACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGACGCTTCTCATCCTTCCACGCTTGGGAAGAGTATTTGCTTGCGGCTTCTCTTGCGAA‑TTCC‑GGTNCTTTTGAAAGTGATAGTGGTGGGGGACGGATTAcccatttctacgccctccgcc > 2:819591/1‑280 (MQ=21) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTT‑GGGAAGTTCA‑GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttcgaaccttcgaagtcgatgacg > 2:455842/1‑278 (MQ=11) ggaTATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGcc > 2:529492/1‑300 (MQ=255) atTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TCCTCAGTGCTACGCGCTTAACCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCCCCGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGTCGAACCTTGGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCNCGCGCGGGCAGAATATTTGATTGCGGGTTCGTTTGGGGG‑TTCA‑GGGGCTTTTGAGAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGTCA‑GCGCTAAGCGCTTAGCCTTTc > 2:781043/1‑300 (MQ=255) ttGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAANCTTGGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCA‑GGGGCTTTTGAGGGTGGTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCttag > 2:220262/1‑298 (MQ=255) ttGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCg > 1:128987/1‑300 (MQ=255) ggTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGcc < 1:547252/300‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGNATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCC‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCgg > 1:632044/1‑300 (MQ=255) cGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAATCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGc < 1:281185/300‑1 (MQ=255) cGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGc < 1:545175/300‑1 (MQ=255) ggCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAC‑CACGCGCTGCGTCCTTAGCCCTGCGGGTCACTGCCTGTGTCACAGCTCTCTCGc > 2:327037/1‑300 (MQ=17) ggCAAAATTAGCGCGTAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCtcgctcgc < 1:891407/300‑1 (MQ=255) cAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTg < 1:563057/300‑1 (MQ=255) aaacgaGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGAc < 1:437969/295‑1 (MQ=255) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGa > 1:162306/1‑300 (MQ=255) gAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCA‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCC‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGa > 1:149230/1‑300 (MQ=255) ttttGATTGTTTAAGGAATCGCTGTTGGTGGGGGCAGGAT‑TATTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCTTTCGG‑GTCGTTGCCTGCTGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCg < 2:533002/300‑1 (MQ=17) tactattcaagtaacagaggctggtggGGTAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCGCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACTGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTGTTAGAA‑TTCC‑GGTGCTTTTGAAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCACTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGc < 2:297975/279‑1 (MQ=14) aGGAATCGATGGTAGTGCGTGAAGGAT‑TACCCAGCGCTGCGCGTTTCTCCCGTCGTTGT‑GTTGTCTGCGTCGGCGCCTTCTCGTTGGCGCTCAAGTCGAACTTTGGTCGGAGCTTCTTATCCTTCCCCGCTGGGTCAGGATATTTGATTGCGGATTAGTTTGAGAG‑TTCC‑GTGGCTTTGGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 2:301707/300‑1 (MQ=14) aGGAAGCGATGTTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTGCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATGCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 1:304168/300‑1 (MQ=255) aGGAAGCGATGGTGGTGGGGTAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTTGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCACTCAAGTCGAACCTTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 1:717982/300‑1 (MQ=255) caatagtggtggGGGAAGGATCGAC‑CAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGTCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTTGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGGAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTTTGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGTGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTTGTGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCCCATCCTTcccc < 2:35849/295‑1 (MQ=17) tggtggtggGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCTGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGTGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:144427/300‑1 (MQ=255) ggtggtggGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGTAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCAt > 1:324782/1‑300 (MQ=255) 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gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCC‑GCGCTGCGCACTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACACTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTGATTTCGGAt > 1:518749/1‑300 (MQ=255) ttCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGagag < 1:48985/300‑1 (MQ=255) ttCGCCCTGCGT‑TTCGTTGCCTGCGTCAACACCCTCTCGCTGGCGCTCAATTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCACCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTGGAAAGTGATGGTGGTGGGGTAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGagag < 2:441586/300‑1 (MQ=17) tCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGCTTGAGAGt > 1:453258/1‑300 (MQ=255) gaccTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCGCTCTCCGACGCTCAAGTCGAACTTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCATAATATTTGATTACGGATTCGTCGGAGGA‑TTCC‑GGGGCTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTc < 2:474446/298‑1 (MQ=17) gCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCTCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGagaggtc < 1:223342/300‑4 (MQ=255) cGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGAc < 1:323980/300‑1 (MQ=255) gg‑gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGANAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACt < 1:639688/300‑1 (MQ=255) gcggcaacgctcgcgcctctgctcTCAGGTCGACCCTTGTTCGGAGCTTCTCCCCCTTCCCCGCTTTTGCAGAGTATTCGATTGCCGATTCTTTTGAGGA‑TTCC‑GGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGAATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGGGAt < 2:431676/277‑1 (MQ=17) 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c‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTATCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGc < 1:313855/300‑1 (MQ=255) gattatttaaggaagcgATGGTGTTGGGGGAAGGATTGCTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATGTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGc < 2:377705/284‑1 (MQ=255) gAAAGTGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGGCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCTAGCCGAACTTTGGTCGAAGCTNCTTATCCGTCCCCGTATGGGCAGAAGATTTGATTGCGGATTCGTTGGAGAGTTCGGGGACTNGTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCt < 2:706026/300‑1 (MQ=14) aTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTGCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCGCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGTAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 1:682006/300‑1 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCCTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATNACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACCGCTCTCTCGCTTGTGCTCGCGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATg > 2:780352/1‑300 (MQ=255) tggGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATGTTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCTCCTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTGGCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGTTTCTCATCCTTCCCCGcctagtcc > 2:81958/1‑293 (MQ=14) gggggAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGCTTNCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTCCAGGTCGTTGCATGTGGCAACGCTCTCTCGATGGTGCTAGAGTCGAACCTTGATAGAAGCGTATCATCCTTCCCCTCATGGGCAg > 1:650844/1‑300 (MQ=17) gggAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAACTTGGTCGAAGCTTCTAACCCTTCCCCGCATGGgaagaa > 1:425433/1‑300 (MQ=255) gactACTCA‑TCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCGTGGGCAGAATATGGGATTGCGGATTCGTTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTa < 1:579565/297‑1 (MQ=14) | CGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGAT‑TACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGG‑GTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAA‑TTCC‑GGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCA‑GCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTA > NC_000913/1286607‑1287202 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |