| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 781222 | 72 (0.650) | 6 (0.070) | 5/446 | 7.7 | 9.3% | noncoding (76/76 nt) | lysY | tRNA‑Lys |
| ? | NC_000913 | 781653 = | 63 (0.760) | intergenic (+1/‑432) | lysQ/nadA | tRNA‑Lys/quinolinate synthase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACG‑ACCCACCAATCTT‑AAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGA > NC_000913/780935‑781516 | cAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCATGCACGACCCACCAGTTTTAACATCa > 1:66274/1‑300 (MQ=255) gATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTCGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATccaa > 1:113288/1‑297 (MQ=255) gCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCATGACGGTTGGTTCGGTGGAAGTATTTTGTAGTCCCCATCGAAGTATGGGGTGAGTAGCTCCGCTGGGAAAGCACCTCCCTTACAAA‑GCGGGGGTCGGCTG‑GTCGATTCCGCCACCAACCACCACTAGGGTAGTTAGCTGGGGTGGTAGAGCAGTTGGCCTTTAATCAATTAGTCGCAGGTTCGAATCATGAACGAACAATCAGTTTTAACATCACACtaggatg > 2:398691/1‑294 (MQ=255) gtgtAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGCACCACCACTAATGACAGCGGGGCCGACGGAAGGAGTGTGGAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCACTTACAAG‑GAGGGGGTAGGTGG‑TTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTAGTTAGCCCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTACAATAAAACTCAGATgcg > 1:302819/1‑298 (MQ=18) ggATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGAACCACCACTACTGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGCCTGCCGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTCGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAG‑GAGGTGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTAATCACCCACCACTAGGGTAGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAATTTTAATCAATTGGTCGCAGGCTCGAATCCTGCACGACCCACCAACTTTAACATCAAACtaaggcgctaaacg > 2:250880/1‑287 (MQ=255) gTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTACTGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGACCCACCAGTTTTAACATTAAACTCAAAGGTTAAgtttgaatgatggcg > 2:391734/1‑286 (MQ=18) gTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACg > 1:40427/1‑300 (MQ=255) tCAGCAACGTCCCTTAGGTCGAACGAAGCGAGTCATCCTACACTACCCGCCACTAATGACGGTTGGTTCTGTGGAAGTAGTTTTTAGTCTCCAGCGCAGTATCTGTTGAGTGGNTCGGCTGTTATAGAAATTTACATGCGAGTGTTGGGGTGGGGAG‑TT‑GAGTCCGGCGGCACCCNCCGATCGGTTTATGAGATCCGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGt < 2:716257/300‑1 (MQ=2) ggCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAg > 2:489915/1‑300 (MQ=255) gacccGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTCCTGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCCGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACCAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCCCTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGCTTTAACATCAAACGCAGATGTGAAGCGTGAAGGATAACGCTgcgcaag > 2:697337/3‑297 (MQ=18) cccGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGNGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCACACCCCGACGTTACGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCa > 2:783994/1‑300 (MQ=255) gggCGAGCGAAGCGAGGCAGCCTGCAAGACACGCCACTAATGACGATGGCTTCGGAAGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCTTAGTATCGGGTGAGTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCCTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGcc < 1:327798/300‑1 (MQ=17) gggctcggagatgtgtataagagacagcacTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAggg < 1:538496/273‑1 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATNCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATNTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCAAGAAACGGCACGTAGGGCGagcgaagcg > 2:823727/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCAACCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACCTCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGagcgaagcg > 1:188604/1‑300 (MQ=255) aTCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTAACTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGNAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTCAACATCACACCCAGAGGTTAAGGGTGAAGGATAACGTTGCGCAAACAGCGGCCCATAGGGCGggcgaagcg > 2:219824/1‑300 (MQ=18) cTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTACCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAACATCAAACTCAGATGTTACGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAATGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGt > 1:418176/1‑300 (MQ=255) aCCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACCCAGATGTTACGCGTGAAGGCTAACGCTACGCAAGCAACGGCCCATAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTg > 2:861772/1‑300 (MQ=255) aCCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTCAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTg > 1:103440/1‑300 (MQ=255) 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CAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAG‑GAGGGGGTCGGCGG‑TTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAGCGAAGCGAGTCATCCTGCACG‑ACCCACCAATCTT‑AAAGATTGGCCCCGAGTAAAAATCTTTCAGGTAACACCCGTATGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCGAGACGA > NC_000913/780935‑781516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |