| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,816,433 | G→A | P3S (CCG→TCG) | gshA ← | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,816,433 | 0 | G | A | 99.0% | 356.8 / NA | 98 | P3S (CCG→TCG) | gshA | glutamate‑‑cysteine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (66/31); total (67/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGCCCATATTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAGATTACCGGTCCCCACGAGATGCGCATCCATCCCGCTAACAGACACAGTAAATCGCCAACCACGGGCATCCAGCTTAATAATAGCGTGACTGCACCATAGCGTTTCAGCCAGCCGGTAGCTTTCTCT > NC_000913/2816154‑2816719 | cGCCCATATTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGcc > 1:784590/1‑300 (MQ=255) cccATATTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTg > 1:808864/1‑300 (MQ=255) cccATATTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCCCCCGCCTg > 2:110971/1‑300 (MQ=255) atatTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCa > 1:267148/1‑300 (MQ=255) atatTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGAACTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCACCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCa > 1:542339/1‑300 (MQ=255) ccGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCCGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCCTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCACAATCGtttt > 2:29715/1‑300 (MQ=255) ccGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCANCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGtttt > 2:184081/1‑300 (MQ=255) ccGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCATGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGtttt > 2:221316/1‑300 (MQ=255) ccGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTAAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGtttt > 1:189289/1‑300 (MQ=255) gTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAGTCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCACTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTaa > 2:279956/1‑300 (MQ=255) gTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTaa > 1:150871/1‑300 (MQ=255) gTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAACAATGCTTCCGCAAAATCGGTCGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGAACTGTTGTTGCCAGTGCGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGCCCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTaa > 2:461782/1‑300 (MQ=255) cgcATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTANTGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATgg < 1:603465/300‑1 (MQ=255) tCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATAtg < 1:539319/300‑1 (MQ=255) cAGCATCTGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCACATTGCNCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATgtgt > 2:606673/1‑300 (MQ=255) gCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGc > 1:697034/1‑300 (MQ=255) atatGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATACTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGTTGACCATATGTGCAg < 2:167019/300‑1 (MQ=255) tatGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAgg < 1:410423/300‑1 (MQ=255) atGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGc > 1:127385/1‑300 (MQ=255) tGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGcc < 2:709697/300‑1 (MQ=255) tGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGcc < 1:269031/300‑1 (MQ=255) gTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCATGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCt > 1:731542/1‑300 (MQ=255) aaTATCACCATCCACTGGTGTAATGGATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTTAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACaa < 2:102891/300‑1 (MQ=255) aaTATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACaa < 1:322946/300‑1 (MQ=255) tatCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTTTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAAtt < 2:308010/300‑1 (MQ=255) atCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCCGGTCTACAATTa > 2:139507/1‑300 (MQ=255) tCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAg > 2:474572/1‑300 (MQ=255) ccACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGccacc > 1:729919/1‑300 (MQ=255) ccACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCACTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGccacc > 1:550955/1‑300 (MQ=255) cTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAANTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCNACcaca > 2:675876/1‑300 (MQ=255) cTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACC‑AATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCAcat > 1:17595/1‑300 (MQ=255) ggTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGNCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCAcatc > 1:602931/1‑300 (MQ=255) ggTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCAcatc < 1:482954/300‑1 (MQ=255) ggTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTAAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTACTTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCAcatc > 1:345210/1‑300 (MQ=255) 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gtaATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGt < 1:222950/300‑1 (MQ=255) aTCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATACTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAAc > 2:738167/1‑300 (MQ=255) gtgCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCAGAGGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTAcc < 2:361692/300‑1 (MQ=255) 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tgtgATACGTCCGAGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAGATTACCGGTCCCCACGAGATGCGCATCCATCCCGCTAACAGACACAGTAAATCGCCAACCACGGGCATCCAGCTTAATAATAGCGTGACTGCACCATAGCGTTTCAGCCAGCCGGTAGCTTTctct > 1:335272/1‑300 (MQ=255) | CGCCCATATTGCGCGCCGTATAACGATGCAGATCGCGCATAAAGGTCAGCATATGTTCAATATCACCATCCACTGGTGTAATGAATTCCAGCAATGCTTCCGCAAAATCGGTAGTAATCCATTTGTGCGTCAGTGCGGAACCTAATGCTTCAGGATGACCTGTTGTTGCCAGTGTGCCATCAGCATTAACACGCAAAGTTTCGCGCTCCAGCCCACGCTGTATCCCCTTTAACGCCTGAGGATGTTTTTCCAGCCAGGCCAGCGCCTGTGATACGTCCGGGATCAAATTGACCTCCCGCCTGTCAAAATCGTTTTAATTAGCATAACTGTAATGGTGACCATATGTGCAGGCCTACAATTAGTGCCACCACATCATGCCCTGAACGGTCGCTGCTGCAACTGCAACATAGCGTAACGCTTTACCAAGGCACAAAAAAAAGATTACCGGTCCCCACGAGATGCGCATCCATCCCGCTAACAGACACAGTAAATCGCCAACCACGGGCATCCAGCTTAATAATAGCGTGACTGCACCATAGCGTTTCAGCCAGCCGGTAGCTTTCTCT > NC_000913/2816154‑2816719 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |