| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,784,599 | G→A | S138F (TCT→TTT) | ypjC ← | DUF5507 domain‑containing protein YpjC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,784,599 | 0 | G | A | 99.4% | 579.5 / NA | 166 | S138F (TCT→TTT) | ypjC | DUF5507 domain‑containing protein YpjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (73/92); minor base C (1/0); total (74/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CCCTTGAACTCATTCACAAACGCATCTTTTTTTTCTTGAATATCTATGGGGTGTTCCTTTGACTCTGACAAAGATGAAATCTCATCTATTTTGTTTTCATATGAATTACGTGATTCCATACAGACATTTGGCGGCGTTTCTAAAATAACACTACGCGTACTACTTGGCTTAAGTAAACCAACATGAAAATCACTTTTTCTTATATTATCGAAAAGGTTCTATTCATTTCTTTTAGCGCATTCAAAAAACTGATCGGCATTATTTTTATTCGATAATTTTTTAGTTTCAGAAAACACATTTTCATTGTTTTCCAGCTTTAGTTTAATGAGAAGATTTTCCCAGACCTGCTTGCTTAAACATATTACGTCAGGCTCACCAGAACTAACTAACTCGTGATTATTATTAAAGTGTACGTTGAATACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATAATGACAAAGGCGTTGCCTTCTTGATATATACATTCAGACATCATTTTTTGTAAAGTTTCAAGAGCACCGCGATACGTCTCTGATGCAG > NC_000913/2784311‑2784881 | cccTTGAACTCATTCACAAACGCATCTTTTTTTTCTTGAATATCTATGGGGTGTTCCTTTGACTCTGACAAAGATGAAATCTCATCTATTTTGTTTTCATATGAATTACGTGATTCCATACAGACATTTGGCGGCGTTTCTAAAATAACACTACGCGTACTACTTGGCTTAAGTAAACCAACATGAAAATCACTTTTTCTTATATTATCGAAAAGGTTCTATTCATTTCTTTTAGCGCATTCCAAAAACTGATCGGCATTATTTTTATTCGATCATTTTTTAGTTTCAAAAAACACAttt > 1:807502/1‑300 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CCCTTGAACTCATTCACAAACGCATCTTTTTTTTCTTGAATATCTATGGGGTGTTCCTTTGACTCTGACAAAGATGAAATCTCATCTATTTTGTTTTCATATGAATTACGTGATTCCATACAGACATTTGGCGGCGTTTCTAAAATAACACTACGCGTACTACTTGGCTTAAGTAAACCAACATGAAAATCACTTTTTCTTATATTATCGAAAAGGTTCTATTCATTTCTTTTAGCGCATTCAAAAAACTGATCGGCATTATTTTTATTCGATAATTTTTTAGTTTCAGAAAACACATTTTCATTGTTTTCCAGCTTTAGTTTAATGAGAAGATTTTCCCAGACCTGCTTGCTTAAACATATTACGTCAGGCTCACCAGAACTAACTAACTCGTGATTATTATTAAAGTGTACGTTGAATACCTTTAAGTTATTTTCACCAACTTCATATTTAATACGTTTTAATTGTTCTCCAGCTCCCATAATGACAAAGGCGTTGCCTTCTTGATATATACATTCAGACATCATTTTTTGTAAAGTTTCAAGAGCACCGCGATACGTCTCTGATGCAG > NC_000913/2784311‑2784881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |