| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 4,572,651 | G→A | D80N (GAT→AAT) | yjiT → | putative uncharacterized protein YjiT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,572,651 | 0 | G | A | 99.2% | 427.3 / NA | 123 | D80N (GAT→AAT) | yjiT | putative uncharacterized protein YjiT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (82/40); total (83/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
ATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATATAAAAAAATAGGGATTTCATTCACCGCCACAGAGCTTGGTACTATCGT‑ACCGAAAGGGATGGAAGATTACTGGCTGCGCCCAATTCGATTTTATGAATCTGAACGACGCAATTTTCTCGGAACATTATTCAGTGAAGGTGGTTTACCTTTCCGGCTACTCAAAGAATCAGACAGTCGCTTTCTGGCTGTTTTCTCCAGGATCCTTGGACAATATGAGCAAGCAAAGCAGTCAGGTTTTTCTGCCCTTTCGCT > NC_000913/4572359‑4572943 | aTTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTTAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGAATTATGa < 1:158909/300‑1 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ATTAGAAATGTTGTGGGGTTTTGTTTTTGTATCTTTTATCTCTAAGGAGCTTGCTTTGGGTCAATCAGAATACATTTCATGGGTAAAATGTACTTCCTGGCTAAGTAACTTTGTGAATCTTAGAGGGTTGAGACAACCGGATGGCCGTCCTCTTTATGAATATCATGCAACCAATGATGAATATACCCAATTAACGCAGCTACTCCGTGCAGTCGGTCAATCACAATCTAATATATGTAATAGGGACTTTGCTGCCTGTTTTGTTCTTTTTTGCTCTGAGTGGTACCGCAGGGATTATGAACGGCAATGCGGATGGACGTGGGACCCTATATATAAAAAAATAGGGATTTCATTCACCGCCACAGAGCTTGGTACTATCGT‑ACCGAAAGGGATGGAAGATTACTGGCTGCGCCCAATTCGATTTTATGAATCTGAACGACGCAATTTTCTCGGAACATTATTCAGTGAAGGTGGTTTACCTTTCCGGCTACTCAAAGAATCAGACAGTCGCTTTCTGGCTGTTTTCTCCAGGATCCTTGGACAATATGAGCAAGCAAAGCAGTCAGGTTTTTCTGCCCTTTCGCT > NC_000913/4572359‑4572943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |