| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,294,035 | Δ141 bp | [tdk] | [tdk] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1294035 | 1294175 | 141 | 120 [0] | [0] 120 | [tdk] | [tdk] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1294034 | 0 (0.000) | 120 (1.220) | 76/578 | 0.1 | 100% | coding (508/618 nt) | tdk | thymidine/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | 1294176 = | 0 (0.000) | intergenic (+32/+1270) | tdk/adhE | thymidine/deoxyuridine kinase/fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase and iron‑dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CCGATTTTCGAGGTGAATTATTTATTGGCAGCCAATACTTACTGGCATGGTCCGACAAACTGGTTGAATTAAAAACCATCTGTTTTTGTGGCCGTAAAGCAAGCATGGTGCTGCGTCTTGATCAAGCAGGCAGACCTTATAACGAAGGTGAGCAGGTGGTAATTGGTGGTAATGAACGATACGTTTCTGTATGCCGTAAACACTATAAAGAGGCGTTACAAGTCGACTCATTAACGGCTATTCAGGAAAGGCATCGCCACGATTAATAAGAATTTCTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCAC > NC_000913/1293879‑1294455 | agattcgtgcggaacatgaacagcaggcaattcattgcgtactggttgatgaatgccagtttttaaccagacaacaagtatatgaattatcggaggttgtcgatcaactcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatacttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggcagtacagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCa > 2:90333‑M2/298‑300 (MQ=255) gtgcggaacatgaacagcaggcaattcattgcgtactggttgatgaatgccagtttttaaccagacaacaagtatatgaattatcggaggttgtcgatcaactcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatacttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggccgtaaagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagacctcataacgaaggtgagcaggGCACTTTTa > 2:787686‑M2/292‑300 (MQ=255) cggaacatgaacagcaggcaattcattgcgtactggttgatgaatgccagtttttaaccagacaacaagtatatgaattatcggaggttgtcgatcaactcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatacttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggccgtaaagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATcc < 1:72390‑M2/12‑1 (MQ=255) gaacatgaacagcaggcaattcattgcgtactggttgatgaatgccagtttttaaccagacaacaagtatatgaattatcggaggttgtcgatcaactcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatanttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggccgtaaagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTg > 2:194344‑M2/287‑300 (MQ=255) 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1:391065‑M2/98‑1 (MQ=255) tgtcgatcaactcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatacttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggccgtaaagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAg < 1:623736‑M2/100‑1 (MQ=255) actcgatatacccgtactttgttatggtttacgtaccgattttcgaggtgaattatttattggcagccaatacttactggcatggtccgacaaactggttgaattaaaaaccatctgtttttgtggccgtaaagcaagcatggtgctgcgtcttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgatcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGt > 1:112512‑M2/192‑300 (MQ=255) 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(MQ=255) ttgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGGCGGTGTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTTACTTAagag < 1:685149‑M2/261‑1 (MQ=255) tgatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTNACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCNCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgagg < 2:566275‑M2/262‑1 (MQ=255) gatcaagcaggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCATGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACACAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAgagga > 2:800111‑M2/38‑300 (MQ=255) caggcagaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCAc < 1:167160‑M2/270‑1 (MQ=255) agaccttataacgaaggtgagcaggGCATTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt < 2:174114‑M2/275‑1 (MQ=255) agaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGTGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGTAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt < 2:294496‑M2/275‑1 (MQ=255) agaccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATACTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGt < 2:227315‑M2/275‑1 (MQ=255) ccttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGAACTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAACATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTc > 2:268780‑M2/23‑300 (MQ=255) ttataacgaaggtgagcaggGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGGGTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTcac < 1:411485‑M2/280‑1 (MQ=255) | CCGATTTTCGAGGTGAATTATTTATTGGCAGCCAATACTTACTGGCATGGTCCGACAAACTGGTTGAATTAAAAACCATCTGTTTTTGTGGCCGTAAAGCAAGCATGGTGCTGCGTCTTGATCAAGCAGGCAGACCTTATAACGAAGGTGAGCAGGTGGTAATTGGTGGTAATGAACGATACGTTTCTGTATGCCGTAAACACTATAAAGAGGCGTTACAAGTCGACTCATTAACGGCTATTCAGGAAAGGCATCGCCACGATTAATAAGAATTTCTTTACTGACAGGGTGAGCAGGGCACTTTTATCCTGTCAGTTCGTTTTACGCACTTCTTCCGGGCTATATACCCTTCTCGGCAGTTTTTTAACGCCG‑‑‑‑‑‑CTATACGCCTCACAGGGCTCTTAAGCACCGACGTTGACTTGTGACCTGTAAAGTACAATATCCCTGTGTTTAGGCGTTATACATCGTCGCAAATATGATGAAGGCTAATGCTGTCGGTTTATGGAAAAGTTGCTTTGGGTAAACAAAAAATACGGCCCCAGAAGGGCAATGCCGTTCACTTAAGAGGAGCGGCACTATGTTTCAC > NC_000913/1293879‑1294455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |