| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2357690 | 91 (0.920) | 4 (0.040) | 4/548 | 6.4 | 4.6% | coding (787/900 nt) | rpnE | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE |
| ? | NC_000913 | 2357874 = | 83 (0.920) | intergenic (+71/+168) | rpnE/yfaU | inactive recombination‑promoting nuclease‑like protein RpnE/2‑keto‑3‑deoxy‑L‑rhamnonate aldolase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAG > NC_000913/2357400‑2357987 | agaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAAc < 1:20645/300‑1 (MQ=255) gaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGNCCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGNACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACa > 2:743828/1‑300 (MQ=255) gaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCTGAAcc > 1:218536/1‑299 (MQ=255) gaTCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACa > 1:167846/1‑300 (MQ=255) aTGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGcc > 1:655966/1‑300 (MQ=255) aTGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGcc < 2:397635/300‑1 (MQ=255) aCATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGAACGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCAATACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTac > 2:448346/1‑299 (MQ=255) gCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGc > 1:511009/1‑300 (MQ=255) gTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCtt > 1:713610/1‑300 (MQ=255) gCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTNGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCANCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTgcgc > 2:734560/1‑300 (MQ=255) gCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACACGCCATTAAAATTGCTTTgcac > 2:326641/1‑298 (MQ=255) gctgGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATgtt > 2:772503/1‑298 (MQ=255) gctgGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCt < 1:639665/300‑1 (MQ=255) gctgGAACTGATTCAAAAGCAGATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCt < 1:400542/300‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAGAAGCATAGTCTCTACCGCGATGTAATCGGCAGGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGTCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGTAGATTGCCGAGCGTTAACCACTACAAAAGGATAGATTAATGACTATTGCTGAGTGGCTACGGCAGTAAGGTCATCAAATTGGTTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGaac < 1:499279/300‑3 (MQ=255) aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGTTCGACGGGATCACCACGCTTTTGGTTATAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTTCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 2:287241/300‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGATGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 2:498171/300‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 1:159952/300‑1 (MQ=255) aaCTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTNAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 1:576033/300‑1 (MQ=255) aaCTGAGTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGTAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGc < 2:425361/300‑1 (MQ=255) cagcgtgttttcggccGCGGTTTAATCTGCATGTTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATGATCTGCTGCAATGCTGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATGGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGaa < 2:263736/286‑1 (MQ=39) aGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGGTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAAc < 1:235543/300‑1 (MQ=255) tCGCGACCGCGATTTAATCTGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGATGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGATGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGAt < 2:299277/300‑1 (MQ=255) tCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGAt < 1:180445/300‑1 (MQ=255) aCCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGcctgtctcttatacacatctcgcag < 1:249879/300‑25 (MQ=255) cgATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGNTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGACCGTGAACTTGTGCtagc > 1:547302/1‑297 (MQ=255) gATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCg < 1:180117/300‑1 (MQ=255) aaTCGGCATGGTCGACAGGACCACCACGCTTTTGGTTAGACGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTgaccaggt < 2:679545/300‑7 (MQ=18) gCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAAc < 1:28279/300‑1 (MQ=255) aTGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTc < 1:252899/300‑1 (MQ=255) gTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCAACCGTTTTATTGCGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCacatcact > 2:259028/1‑293 (MQ=255) gACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTCCAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTgaacaggtgctcgcggccacc > 2:491626/1‑281 (MQ=17) gATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTNATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTNCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTAACTGATGCTGa > 2:562758/1‑300 (MQ=255) caccacGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTNAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGANCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGatat < 2:740980/300‑1 (MQ=255) tGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTc > 1:430770/1‑300 (MQ=255) gttcgagGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACACACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCAATAAAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACCACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTcct > 1:144645/5‑298 (MQ=255) gTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATACTCCGAACTGTCAt > 1:615395/1‑300 (MQ=255) gagGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCGGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGATAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTaaa < 2:344803/300‑1 (MQ=255) ttCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGTAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTGGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGgag < 1:752027/300‑1 (MQ=255) 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2:8931/300‑1 (MQ=255) cagccagcTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGAc < 1:226541/300‑1 (MQ=255) gctgcAAACCCTGTTTCATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCCGAAGCAAGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCCACTCACTGCTGCTGATATTCCGCACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAACGACCATTGc > 2:342856/5‑300 (MQ=255) 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1:436193/1‑300 (MQ=255) gga‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGANCTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAg < 2:698498/298‑1 (MQ=255) | AGATCATGCAACATCGGCGTATAGCTCTGCTGGAACTGATTCAAAAGCATATTCGCGACCGCGATTTAATCGGCATGGTCGACAGGATCACCACGCTTTTGGTTAGAGGCTTCACTAATGACAGCCAGCTACAAACACTGTTTAATTATCTGCTGCAATGCGGCGATACCTCCCGTTTCACCCGTTTTATTGAGGAGATTGCCGAACGTTCACCACTACAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTACGGCAGGAAGGGCATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAGCAGGGCTTTGAACGTGAGATTGTGCTGGCGACAACCCAACTCACTGATGCTGATATTCCGAACTGTCATTAAAAGGAGAGATTAATGACTATTGCTGAACGGCTGCGGCAGGAAGGACATCAAATTGGCTGGCAGGAAGGTAAATTAGAAGGTTTGCATGAACAAGCCATTAAAATTGCTTTGCGCATGCTGGAACAGGGCTTTGATCGTGACCAGGTGCTCGCGGCCACCCAGCTAAGCGAAGCCGATCTGGCAG > NC_000913/2357400‑2357987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |