| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,206,654 | C→T | A320A (GCC→GCT) | yehM → | uncharacterized protein YehM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,206,654 | 0 | C | T | 98.5% | 241.8 / NA | 68 | A320A (GCC→GCT) | yehM | uncharacterized protein YehM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (34/33); minor base G (0/1); total (34/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCCATAGCAGGCTCGCTGATTAAAGAAGCCCTGAACGCGCCGTTGCCGTGGAGCTATCGCGGCGTTATTCATCCCGATACCGATCCGATTCTGCTAACGTTGATAGACACATTAGCGGGTGACGGATTCGGTAAACTTGCCCCTTCTACGCCACAACCGCCTCTGCCAAAAGATGTCACCTGCGAACTGGAACGTACCGCAATCTCCCTTCCGGCGGAGCTTACCTTAAATCGCTTTACCCCCGATGGGCTGGCGCAAAGTCAGGTGTTACATCGGCTGGCAATACTGGAGATCCC > NC_000913/2206360‑2206947 | gCCCTCGTTGGCGGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCTATAGc < 2:367790/300‑1 (MQ=255)gCCCTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTGGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGNCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCTATAGc < 2:731639/300‑1 (MQ=255) cccTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGTGAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATGGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCAGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCTGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCTATAGCa < 2:365403/300‑1 (MQ=255) ccTCGCTGGCAGATGCCGTTACAGGTTGTTATCTCACACCCTACAGGTAAAAGCGCCTTGATGTGCTGGCAGGATACCTTTCAGGAATGCCTGCCCCGGTATTGCAAAACTGGTGCTGGCAGTGGGGCTTGCNGAAGGCCGGTGAACAACTGCTAAAAACTATCCTTACCCGTTTGCGCCAGCACAAATTGCCCGCTTCTACCGCGGATATGGCGGCCGCTCATCTGCATGCGATGGCGCTGGCACAGTTGCGCGGTCATACACTACCGTTACGCACTGACTGGCTGGATGCTATAGCAg < 2:204761/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |