| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,978,243 | G→T | intergenic (‑46/+275) | flhD ← / ← insB5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 family protein InsB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,978,243 | 0 | G | T | 99.2% | 452.0 / NA | 129 | intergenic (‑46/+275) | flhD/insB5 | DNA‑binding transcriptional dual regulator FlhD/IS1 family protein InsB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (55/73); minor base C (0/1); total (55/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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aCCTCACCCCGTGATGTCGCCTGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACA‑CAAAACACTCAATTACTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtc > 1:90032‑M2/1‑255 (MQ=255) aCCTCACCCCGTGATGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTNCTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACA‑CAAAACACTCAATTACTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaactcttctcggctgactcagtc < 2:187125‑M2/300‑46 (MQ=255) aCCTCACCCCGTGATGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACA‑CAAAACACTCAATTACTTAAggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtc > 1:526399‑M2/1‑255 (MQ=255) | GCGGGAATCTTGCGTCAACTGAGTAATCGTCTGGTGGCTGTCAAAACGGAAGTGACAAACCAGTTGATTGGTTTCTGCCAGCTTAACCATTTGCGGAAGAGTCAGTGCCGCTAACGTTGTCGCCATTTCTTCATTTATGCCGAGACGAAACATAGCGGACGCTTTGTCCTGAACAATCAAACGCTGTGCAAGTAGTAAATATGACAAGTTGATGTCATAAATGTGTTTCAGCAACTCGGAGGTATGCATTATTCCCACCCAGAATAACCAACTTTATTTTTATGCGGTTTCACCGCACCCCGTGATGTCGCCGGGAAGCCCCGGTAAAAAATAATTAGCATTAGAATAGTTGCGATAAGCTGCAATAAGCAGAACCACCTTTTTGGTTTAATATGTCCTTACAAATAGAAATGGGTCTTTACACTTATCTAAGATTTTTCCTAAATCGACGCAACTGTACTCGTCACTACACGCACATACAACGGAGGGGGGCTGCGATTTTCAATAATGCGTGATGCAGATCACA‑CAAAACACTCAATTACTTAACATAAATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > NC_000913/1977949‑1978539 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |