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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
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aTTCATCGTCACTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGTTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTTGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGAc < 2:84085/300‑1 (MQ=255) aTTCACCGTCACTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGAc < 1:33043/300‑1 (MQ=255) cTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCTCAGTCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTTTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAatat < 2:117787/300‑1 (MQ=255) cTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAatat < 1:737077/300‑1 (MQ=255) cccGGACAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAANGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTANTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCAcc < 2:555208/300‑1 (MQ=255) gCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCTTTTAATCCt > 1:659035/1‑300 (MQ=255) | CGCCGGAACACCATTCAGCGTGCCTTTGGCGATATCAGCCCCTTCGATATCAGCAAAATCTTTACCTGGGAAAACGGCGTGAGCATGGCCAAACATAATGGCGTTAACGCCCGGAATTTCACTGAGGTAATAAACTGAGTTTTCCGCCATCACTTTATACGGATCGGCAGATAGCCCGGAATGTGCCAGAACGACAACAACATCGGCACCTTTCTCGCGCATTTCAGGCACGTATTTGCGCACGGTTTCGGTAATATCATTCACCGTCACTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCCCAGCCCATGATTTGTGGTGG‑CACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCTTTTAATCCT > NC_000913/4435711‑4436296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |