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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAACTTGCTCTTTTCTTCTGGTGTTTATCTTTGAAAGATTTGTAGGATAAATAACATTAAGTAAAGCCGCATCGGCTTCTCTGTAATGTTTATCTTTTTCCAGATAACCTGGGGATTCTCCCCCTAAATCAAGCTGTAACGTTATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCACC > NC_000913/2997396‑2997989 | gAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAACt < 2:764634/300‑1 (MQ=11) 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gTCTAAACTTGCTCTTTTCTTCTGGTGTTTATCTTTGAAAGATTTGTAGGATAAATAACATTAAGTAAAGCCGCATCGGCTTCTCTGTAATGTTTATCTTTTTCCAGATAACCTGGGGATTCTCCCCCTAAATCAAGCTGTAACGTTATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTc > 1:61890/1‑300 (MQ=255) gTCTAAACTTGCTCTTTTCTTCTGGTGTTTATCTTTGAAAGATTTGTAGGATAAATAACATTAAGTAAAGCCGCATCGGCTTCTCTGTAATGTTTATCTTTTTCCAGATAACCTGGGGATTCTCCCCCTAAATCAAGCTGTAACGTTATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTAGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTc > 1:227229/1‑300 (MQ=255) tAAACTTGCTCTTTTCTTCTGGTGTTTATCTTTGAAAGATTTGTAGGATAAATAACATTAAGTAAAGCCGCATCGGCTTCTCTGTAATGTTTATCTTTTTCCAGATAACCTGGGGATTCTCCCCCTAAATCAAGCTGTAACGTTATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCAcc < 1:518829/300‑1 (MQ=255) | GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAACTTGCTCTTTTCTTCTGGTGTTTATCTTTGAAAGATTTGTAGGATAAATAACATTAAGTAAAGCCGCATCGGCTTCTCTGTAATGTTTATCTTTTTCCAGATAACCTGGGGATTCTCCCCCTAAATCAAGCTGTAACGTTATTCTTTCATAACCTTTATCTATGAGGTGGTTCAACCTCGTTGTTGAAAGAGTTTCATCCAGTTCATTGACTTTAGCTTCGCGTAGTAAATCAGAGACAAAAACAGAGTCTTTCTTCGAGAGTAGGTTTGACAAACGTTCCAGTCCAGAGGTCACC > NC_000913/2997396‑2997989 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |