Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 313,543 | 0 | G | A | 99.2% | 438.6 / NA | 125 | intergenic (‑301/‑1748) | ykgR/insE1 | putative membrane protein YkgR/IS3 element protein InsE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (73/51); minor base C (1/0); total (74/51) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATCTCAAGACTGGCCCAGTCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGG > NC_000913/313256‑313837 | cTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACTAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATCTCAAGACTGGCCCAGTCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTACTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGAAATTGAGTTCTa > 2:447515/1‑300 (MQ=255) 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CTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGATATATGTCGCCTGAAGTCAGTTCCGGGAATGAGTCTGATCTCAAGACTGGCCCAGTCCGGGCGTTGATTGGTGCTGAGGAGCATATCGCATCTCATCATAATGTCGTATCTCCTGGGGTGTTATACAAGATATCGTTGTTGGTGACCTGGGAGAGGAATTGAGTTCTATTAAACCGTCAACTATGCCGGATACATACTGGATTACACTGCAGGCACGCCTTATGAGAGAACGTGCCGCAGTGACGGGTTAATTATCTGAAAGAATTTGTGAGGCTGTATCGGTTACTCATTGATTTGATAGTTTTACTCTCGGGAGAATAATAGATATTTAATCCATTAACGGAAACCAGCCAGTTCCTTTCGATGCCTGAATTTGATCCCATAGTTTATCCGGAATGGTTAATTCATGAACAAGTTGTGTTATCGTTCATGAGAAGCATAACGTAAAGG > NC_000913/313256‑313837 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |