New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4392437 | 92 (0.950) | 4 (0.060) | 4/442 | 7.6 | 5.3% | intergenic (+2/‑35) | glyV/glyX | tRNA‑Gly/tRNA‑Gly |
? | NC_000913 | 4392661 = | 74 (1.030) | intergenic (+3/‑231) | glyY/yjeV | tRNA‑Gly/uncharacterized protein YjeV | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAATCA > NC_000913/4392369‑4392959 | gCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCACGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGACAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTtctc > 1:184408/1‑300 (MQ=255) cAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCNGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCa > 1:549438/1‑300 (MQ=255) gagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCANAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCAAAATTCTTCTATCAATCAAatat > 1:536497/1‑300 (MQ=255) agCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATc > 1:331131/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑Gc > 1:124294/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCAGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGAACACCCAGGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCAAAGGTTGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAATATTCACA‑Gc > 1:630716/1‑300 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATgt > 1:302560/1‑299 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGc > 1:416354/1‑300 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCAAA‑GCGACGCGGTGc > 1:685451/1‑300 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTATATCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGc > 1:656789/1‑300 (MQ=255) ggTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCAGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAACATCCACA‑GCGACGCGAttc > 1:732131/1‑298 (MQ=255) tCGCGAGTTCGAGTCTCTTTTCCCGCTCCAAAAGTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAATCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGc < 2:123904/300‑1 (MQ=255) gAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGt > 1:739881/1‑300 (MQ=255) aTTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTaa < 1:17296/300‑1 (MQ=255) ttGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAAc < 1:785912/300‑1 (MQ=255) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTGAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAGGGCACAGACCACCAAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGCGCACAAACCTACCAAGGTCAAGATCGCGAATTCGAGTCCCGTTTCCCGCCCCACATTCTCCCCTCAATAGAATATCC‑CACGTGGCGCGCTGCGTTATCGTTGGTTTTTGTTGtctatgccgaagtcttgtccacatagtta > 2:111190/1‑274 (MQ=12) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGTGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTa > 1:205104/1‑300 (MQ=255) gTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTa > 1:725544/1‑300 (MQ=255) ctgcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATcc < 1:463192/300‑1 (MQ=255) gcAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCcac > 1:767638/1‑300 (MQ=255) gcAAAACACAGACCACTCAAACGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTGTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGACACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGTTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCcac < 2:61505/300‑1 (MQ=255) gcataGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGACA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGGGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAACATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGcat > 1:99328/5‑298 (MQ=255) gCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGCGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCACATTCTTATAGCAATGAAATATCCAAA‑GCGACGCGATGCGTGATTGCTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTAAGCAGAGTTATCCACAGCCt > 2:400667/1‑300 (MQ=18) gACCACCCAAGCTGGAAGAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGc < 1:283000/300‑1 (MQ=255) gACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAACATTTGAAA‑GTGCTATAAGGCACAGACCACCCAAGTGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAACTTGCCAAGGTCAGGATCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCCAATTCTTCTCTCAATAAAGTATCCACA‑GTGACGCTCTGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTATGACAAACTCTTGTCAATAGAGGTATCCACAGCCTCAggt > 2:240783/1‑299 (MQ=18) 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aGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGTGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAACCAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCtt > 1:163046/1‑300 (MQ=255) aGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGCAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCACATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGTTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTAAGGCTGTAATCtt > 1:633489/1‑300 (MQ=255) gAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTTGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGTCCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCAGCTCCAAATTCTCATCTCAATCCACTATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGTTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACCGAGTTATCCACCGCCTCAGGTTGTactattacttt > 2:397781/1‑290 (MQ=18) aaTAGCTCAGTTGTTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGTTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTGCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCATGCTGTAATCTTAATTTc < 2:424707/300‑1 (MQ=255) cAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTTCAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGCATCGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCAGGGTCGCGAGTTCGAGTCCCGTTTCCCGATCCACACTCTTCTATCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCCATGCGTCATTGCTGGTTTTTGTTGTATCTGACAAACTCTTGTAAAAAGAGTTATCCACAGCATAAGGCTGTAATACTACTTTCAAAGaaa > 2:400421/1‑300 (MQ=18) cAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCATGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCACATTCTTCTCTCAATAAAATATCCCCA‑GCGACGCGATGCGCTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTACACAGAGTTATCCACAGCATCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGaaa > 2:721631/1‑300 (MQ=255) cAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCAAA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGaaa > 1:696008/1‑300 (MQ=255) aGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTACTGTAAGGCACAAACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACAACCCTACCCAGGTCGGAGTCGAGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGTGTCCTTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCCTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAGTCTTACTTTCAAAGagaa > 2:472428/1‑297 (MQ=21) tGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAACGAAACTTc > 1:719027/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTAAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAAt > 1:82696/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTACATCACTAGAATATCCAGA‑GCGACGCGGTGGGGTCTGGTTGGTTTTTGTTGTCTATACCCAACTATTTTAAACCGAGTCATCCACATCCTAAGGCTATCATCAGAATTTCAAAGAAACTTAGCattatgaat > 1:758429/1‑292 (MQ=2) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTCTCCACAGCCTAAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATa > 1:723509/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATa > 1:32526/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTAAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATa > 1:764161/1‑300 (MQ=255) aCCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTATCAATAGAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGCCAAACTCCTGTAAACCGAGTTATCCACAGTCTCAGGCTGTAATCTTACTTCCAAAAAAACTTCGCCCGGTGCATa > 2:104807/1‑300 (MQ=21) 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ccAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTAAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGTTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCa > 2:16760/1‑300 (MQ=255) aaaTTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAAt < 2:712664/300‑1 (MQ=255) aTTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAATCa > 1:638000/1‑300 (MQ=255) | GCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAA‑GTGCTGTAAGGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTCTTCTCTCAATAAAATATCCACA‑GCGACGCGATGCGTTATTGCTGGTTTTTGTTGTCTCTGACAAACTCTTGTAAACAGAGTTATCCACAGCCTCAGGCTGTAATCTTAATTTCAAAGAAACTTCGCACGGTGAATAGTATTTTTTTAACCTATTGATAGATAAGTTAAAAATTAAGATTCCGTTTTGTCGAGTCGATCACTTGACGATTTTATTCGTCTTGAATTGCAATGCGTTTTTATTTTTATTCACAAGCTGTGGATGAATCAGGCGTCACGCGGTAACCCTTTTTCAATCA > NC_000913/4392369‑4392959 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |