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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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tCCCGGATAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTTGCACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTCTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCAc < 2:57630/300‑1 (MQ=255) cccGGATAAATTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGGCACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTNTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCAcc < 1:505322/300‑1 (MQ=255) aaaTTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGGCACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCtttt > 1:473600/1‑300 (MQ=255) aaTTAGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGGCACTACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCTTTTa > 1:23524/1‑300 (MQ=255) ttAGCTTGATCGCAGATCATGATTGGTGGTGGCACGACGCCAATATAGCCAATCTGCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTGATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTGGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAACGCATTTTTCAGGTAACCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGTGTATTTAGTGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCTTTTAAt < 2:361539/300‑1 (MQ=255) aGCTTTATCTCAGCCCATGATTTGTGGTGGCACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCAGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGANTCTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGAACGTAGTTAACCTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTCTTTAATGCATTATAGACCGAGTGAACATCACCTGCTTTTAATcc > 2:161536/1‑300 (MQ=255) | CCGCCGGAACACCATTCAGCGTGCCTTTGGCGATATCAGCCCCTTCGATATCAGCAAAATCTTTACCTGGGAAAACGGCGTGAGCATGGCCAAACATAATGGCGTTAACGCCCGGAATTTCACTGAGGTAATAAACTGAGTTTTCCGCCATCACTTTATACGGATCGGCAGATAGCCCGGAATGTGCCAGAACGACAACAACATCGGCACCTTTCTCGCGCATTTCAGGCACGTATTTGCGCACGGTTTCGGTAATATCATTCACCGTCACTTTCCCGGATAAATTAGCTTTATCCCAGCCCATGATTTGTGGTGGCACGACGCCAATATAGCCAATCTTCAGCGTCTGTTTTTTTCCGTCTTTATCGACCACTTCGGTGTCTTTAATTAAATACGGTGTAAACATTGGCTGTTTGGTTCTGGCGTCAATGACGTTGGCATTTACATAAGGGAATTTCGCTCCTGCCAGCGCATTTTTCAGGTAATCCAGACCGTAGTTAAACTCGTGGTTGCCAAGCGTTCCGACGGTATAGTCCAGCGTATTTAATGCCTTATAGACCGGGTGAATATCACCTGCTTTTAATCCTT > NC_000913/4435710‑4436297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |