| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,456,421 | G→A | *166* (TGA→TAA) | paaD → | phenylacetate degradation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,456,421 | 0 | G | A | 98.1% | 367.7 / NA | 105 | *166* (TGA→TAA) | paaD | phenylacetate degradation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (57/46); minor base C (2/0); total (59/46) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGCCAGCGTCCATACCACACTTATCAGTGAATTTGGTTCCACGGCCTGCAAAGCATTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGT > NC_000913/1456129‑1456716 | aTACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTANCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGNCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGCCAGCGTCCATACCACACTTATCAGTGAATTTGGTTCCACGGCCTGCAAAGCATTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTAAGGATGc > 2:561596/1‑300 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ttCAAATGTATTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGAc < 2:507776/300‑1 (MQ=255) cAAATGCATTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGANTTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTANGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGc < 2:576369/300‑1 (MQ=255) cAAATATATTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGc < 2:330306/300‑1 (MQ=255) aTGTATTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTgg < 2:144516/300‑1 (MQ=255) gTATTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATCCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAACGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCATTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAAGTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTACCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAg > 2:310929/1‑300 (MQ=255) aTTTAAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGt > 1:660425/1‑300 (MQ=255) | ATACGTGAGGCAATGACAACCAACGGGTTTACCCCCGTTCAGGTTGTGCTGCAACTCGACCCGGCATGGACCACCGACTGGATGACCCCCGATGCCCGTGAGCGTCTGCGAGAGTATGGCATTAGCCCGCCCGCCGGACACAGTTGCCATGCCCATTTGCCGCCAGAAGTACGTTGCCCGCGCTGCGCCAGCGTCCATACCACACTTATCAGTGAATTTGGTTCCACGGCCTGCAAAGCATTGTACCGCTGCGATAGTTGCCGCGAACCTTTCGATTATTTCAAATGTATTTGAGGATGCCATGACAACGTTTCATTCCTTAACAGTGGCAAAAGTCGAGTCGGAAACCCGTGATGCGGTGACCATTACCTTTGCGGTGCCCCAGCCTTTGCAGGAGGCGTATCGCTTTCGCCCCGGTCAACATTTGACCTTAAAAGCCAGCTTTGATGGTGAAGAATTACGCCGTTGTTACTCCATTTGCCGCAGCTATCTGCCTGGCGAAATTAGTGTGGCGGTGAAAGCCATTGAAGGCGGACGTTTCTCCCGCTATGCCCGCGAACACATCCGCCAGGGTATGACGCTGGAGGT > NC_000913/1456129‑1456716 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |