| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,596,347 | IS2 (–) +5 bp | intergenic (‑3905/+2266) | hipB ← / ← lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | 116 (1.120) | 62/596 | 0.4 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1596351 | 0 (0.000) | intergenic (‑3909/+2266) | hipB/lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | 119 (1.150) | 73/598 | 0.2 | 99.2% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1596347 = | 1 (0.010) | intergenic (‑3905/+2270) | hipB/lsrK | antitoxin/DNA‑binding transcriptional repressor HipB/autoinducer‑2 kinase | |||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
TTATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGC > NC_000913/1596048‑1596645 | tATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCTGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAACAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCt < 2:517793/300‑1 (MQ=255) 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aTTGAGAGCTATCTGTGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcctctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgatactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctattccgttactctccggactccgcaccgccgtgttcttcggttcaagtcccaacatccggg < 1:383920‑M2/300‑284 (MQ=255) gccagtctaCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGTTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 1:83855‑M2/291‑1 (MQ=255) agtctaCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCNGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCACTAATGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACCTTGATACCCCCAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCCGGTTCAGTGTGCCGAt > 2:207600‑M2/7‑300 (MQ=255) 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TTATTGGTATGATTAAAGACAAAAACGCCTTCGCCAAGACCAAACTCCACTTTCGTCGCATTGGTGATAAATCCGGCATCTGCCGCCGCCTCACCGTGAGCAGCACCAATGTTTAGCGTTCCTACAGCAGGCTCAAAAACACCTAAGTAAACTTCTCCACCTTCGACATTCAGCGTACCGTTATTCGTCAGGGTTAACGTACCCGTACCAGATGTCCCTACGTACATATTGAATGTTTCAAGAAGAGAGTTCTGCCCATCCACCCTCACGTCGCCCTTACTTTTGTCATTGAGAGCTATCTGTGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGC > NC_000913/1596048‑1596645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |