| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 932,362 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑312/‑229) | trxB ← / → lrp | thioredoxin reductase/DNA‑binding transcriptional dual regulator Lrp |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 381260 = | NA (NA) | 113 (1.090) | 74/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 932366 | 0 (0.000) | intergenic (‑316/‑229) | trxB/lrp | thioredoxin reductase/DNA‑binding transcriptional dual regulator Lrp | |||||
| * | ? | NC_000913 | 932362 = | 0 (0.000) | 96 (0.930) | 64/596 | 0.3 | 100% | intergenic (‑312/‑233) | trxB/lrp | thioredoxin reductase/DNA‑binding transcriptional dual regulator Lrp |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CATTAAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/932658‑932362‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCG > NC_000913/1467910‑1468194 CATTAAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCCGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTATCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCAATGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTAAGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTCGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGG > 2:415699/1‑300CATTAAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGG > 2:362251/1‑300 TTAAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCNGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGAT < 2:717564/300‑1 AAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTT < 1:109492/300‑1 AGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCATGGCGCTTCGTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACTGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTG < 2:227107/300‑1 TGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCC < 1:652337/300‑1 GTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCT > 1:698569/1‑300 ATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:359969/1‑300 ATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCNCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGCCCCTGAAACCTCACTGTTCAGAGCCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGCAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGTAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATCCGTAGATTTCACTNGCACGGTAAACATGGTATTTCCATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 2:765479/1‑300 GTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC < 1:464770/300‑1 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CGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCC > 1:31440/1‑300 CGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGNCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCC > 1:568090/1‑300 CATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATC < 1:468896/300‑1 CATGGTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCGCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTGGGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATC < 1:23826/300‑1 GTATTTCCATGCATGGTTGGATTTGCCCATCTATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCAAGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGG > 1:746370/1‑300 GTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGG > 1:348253/1‑300 GTATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCAAGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGG > 1:195908/1‑300 ATTTACATGCATGGTTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCG < 1:18974/300‑1 CATTAAGAATGTTACGATCGATACGGTCGAGATCTTTGCCAGGGCGCTTCTTGCTATCTACCATTATTATTGTCTCTCTGTATTCCTTCCCTACTCCTGTCTGACCCTGAAACATCACTGTTCAGAGTCGCTACCCGTCACGATAGACCGAAATCATGAAGATTCACGGCGCGCAATGCCTGGGTCTACGGTGAGAAGACCGTTGCCTTGTGGCAGCTATCGACATCACGAATGGCGTCTGTCCACGCCATACGTAGATTTCACTAGCACGGTAAACATGGTATTTACATGCATGGTt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/932658‑932362‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCTGCCGTTAACCCGTCTGGTTTGGGCATGATACTGATGTAGTCACGCTTTATCGTTTTCACGAAGCTCTCTGCTATTCCGTTACTCTCCGGACTCCGCACCGCCGTGTTCTTCGGTTCAAGTCCCAACATCCGGGCG > NC_000913/1467910‑1468194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |