| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 578,014 | IS2 (–) +5 bp | coding (402‑406/498 nt) | rrrD → | lysozyme |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 578014 = | 0 (0.000) | 108 (1.040) | 75/596 | 0.1 | 100% | coding (402/498 nt) | rrrD | lysozyme |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/382295‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATGTAGCTG < NC_000913/578018‑577723 ACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCNTTATAACGAACGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACANATGTCTGGAAGTATAGGGGCAAATCCAGCAG < 2:587788/300‑1 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GGGCAAATCCAGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTAT < 1:505748/300‑1 GGGCAAATCCAGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGNAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTAT < 1:561085/300‑1 AATCCAGCATCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACTTTGTAAACGAATGAGGAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGCCTGGCGACATTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATttacc < 2:750531/300‑6 AATCCAGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATGTAGC < 1:88839/300‑1 AATCCAGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCGGGTTTATTTGGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGCTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATGTAGC < 2:457675/300‑1 TCCAGCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATGTAGCTG < 1:811621/300‑1 ACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/382295‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCAGCTGATCACATGCGCCTTTGATATCGCCCTGGTTTATTTTGCGAAGAAGCGTCGATGTTCTAAAATTGCCAGCACCCACGTTGTAAACGAATGAGTAAAGAGCGCCGCGCGTTGTTTCCGGTATATCGACTTTGATATACGGGTTAATTTGTCTGGCGACAGTGGCAAGGTCTTTATTCAAGAGTGCTTTGCATTCTGCTTTGGTATACGTTTTACCGAGCATGATGTCTTTTCCGGTGTGTCCGTGACATACAGTCCATACACCAACAATATCTTTGTATGGTATGTAGCTG < NC_000913/578018‑577723 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |