| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,837,039 | G→T | A29A (GCG→GCT) | setC → | putative arabinose exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,837,039 | 0 | G | T | 99.4% | 558.9 / NA | 160 | A29A (GCG→GCT) | setC | putative arabinose exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (63/96); minor base C (0/1); total (63/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
CTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCCTATAATGGTAGGTTTTTTCTTCACCGGTAGCGCTATTATGGGAATTCTGGTCAGTCAATTTCTGGCAAGGCACTCCGATAAACAAGGCGACCGTAAATTACTGATTCTGCTATGTTGCTTATTTGGAGTGCTGGCCTGCACGCTTTTTGCGTGGAATCGCAACTACTTCATTCTCCTCTCAACGGGCGTACTTCTGAGTAGTTTTGCTTCCACCGCAAACCCGCAAATGTTCGCCC > NC_000913/3836745‑3837334 | ttGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTAGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCGTTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCTGGCGCTCtt > 2:420152/1‑300 (MQ=255) 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aCTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCTGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCCTATAATGGTAGGTTTTTTCTTCACCGGTAGCGCTATTATGGGAATTCTGGTCAGTCAATTTCTGGCAAGGCACTCCGATAAACAAGGCGACCGTAAATTACTGNTTCTGCTATGTTGCTTATTTGGAGTGCTGGCCTGCACGCTTTTTGCGTGGAATCGCAACTACTTCATTCTCCTCTCAACGGGCGTACTTCTGAGTAGTTTTGCTTCCAc > 1:543133/1‑300 (MQ=255) tGACGGGTATTGCTGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCCTATAATGGTCGGTTTTTTCTTCACCGGTAGCGCTATTATGGGAATTCTGGTCAGTCAATTTCTGGCAAGGCACTCCGATAAACAAGGCGACCGTAAATTACTGATTCTGCTATGTTGCTTATTTGGAGTGCTGGCCTGCACGCTTTTTGCGTGGAATCGCAACTACTTCATTCTCCTCTCAACGGGCGTACTTCTGAGTAGTTTTGCTTCCACCGCAAACCCGCaaa < 2:478239/300‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCCTATAATGGTAGGTTTTTTCTTCACCGGTAGCGCTATTATGGGAATTCTGGTCAGTCAATTTCTGGCAAGGCACTCCGATAAACAAGGCGACCGTAAATTACTGATTCTGCTATGTTGCTTATTTGGAGTGCTGGCCTGCACGCTTTTTGCGTGGAATCGCAACTATTTCATTCTCCTCTCAACGGGCGTACTTCTGAGTAGTTTTGCTTCCACCGCAAACCCGCAAATGTtcgccc > 1:482009/1‑300 (MQ=255) | CTCATTGCCTTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCCTATAATGGTAGGTTTTTTCTTCACCGGTAGCGCTATTATGGGAATTCTGGTCAGTCAATTTCTGGCAAGGCACTCCGATAAACAAGGCGACCGTAAATTACTGATTCTGCTATGTTGCTTATTTGGAGTGCTGGCCTGCACGCTTTTTGCGTGGAATCGCAACTACTTCATTCTCCTCTCAACGGGCGTACTTCTGAGTAGTTTTGCTTCCACCGCAAACCCGCAAATGTTCGCCC > NC_000913/3836745‑3837334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |