| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 577,400 | IS3 (–) +3 bp | coding (3‑5/216 nt) | essD → | putative phage lysis protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 577400 = | 0 (0.000) | 73 (0.740) | 58/596 | 0.4 | 100% | coding (3/216 nt) | essD | putative phage lysis protein |
| ? | NC_000913 | = 1095502 | NA (NA) | noncoding (1/1258 nt) | IS3 | repeat region | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AATTATTTTTTGGTTATTTGTTGAGATTTGCTTATGTATTTGTAGTGGTGTTTTCAATACTCGGTAGCATTCTCTCAAATATCATTTAGTGGTTTACGTACGTAAAAAATTGGTTATGCTGTTAAGAGTGGTTACTTCGTCACACAGCTTAAACCCGCCGTCGAGCGGGTTTTTCCATTTTTTGAGTCTCGATATTAGCTGATAACCCAATACCTGAGTTATTCACTGACTCCGAGTCTGTTACGTTTCGTAGTATTCCCTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTATGAAATCCATGGATAAGTTAACAACGGGTGTCGCCTATGGCACCTCAGCAGGTAGTGCCGGGTACTGGTTTTTACAGCTGCTAGATAAAGTCACTCCCTCACAGTGGGCAGCAATAGGTGTGCTGGGTAGCCTGGTATTTGGCCTGCTGACGTACCTGACAAACCTTTATTTCAAGATTAAAGAAGATAAGCGCAAGGCTGCGAGAGGTGAATAATGCCTCCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGT > NC_000913/577103‑577699 | aaTTATTTTTTGGTTATTTGTTGAGATTTGCTTATGTATTTGTAGTGGTGTTTTCAATACTCGGTAGCATTCTCTCAAATATCATTTAGTGGTTTACGTACGTAAAAAATTGGTTATGCTGTTAAGAGTGGTTACTTCGTCACACAGCTTAAACCCGCCGTCGAGCGGGTTTTTCCATTTTTTGAGTCTCGATATTAGCTGATAACCCAATACCTGAGTTATTCACTGACTCCGAGTCTGTTACGTTTCGTAGTATTCCCTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTATGaa < 1:778698/300‑1 (MQ=255) 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attgctgggtaagatcaGAAATCCATGGATAAGTTAACAACGGGTGTCGCCTATGGCACCTCAGCAGGTAGTGCCGGATACTGGTTTTTACAGCTGCTAGATAAAGTCACTCCCTCACAGTGGGCAGCAATAGGTGTGCTGGGTAGCCTGGTATTTGGCCTGCTGACGTACCTGACAAACCTTTATTTCAAGATTAAAGAAGATAAGCGCAAGGCTGCGAGAGGTGAATAATGCCTCCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAgtgt < 2:233659‑M1/283‑1 (MQ=255) attgctggggaagatcaGAAATCCATGGATAAGTTAACAACGGGTGTCGCCTATGGCACCTCAGCAGGTAGTGCCGGGTACTGGTTTTTACAGCTGCTAGATAAAGTCACTCCCTCACAGTGGGCAGCAATAGGTGTGCTGGGTAGCCTGGTATTTGGCCTGCTGACGTACCTGACAAACCTTTATTTCAAGATTAAAGAAGATAAGCGCAAGGCTGCGAGAGGTGAATAATGCCTCCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAgtgt > 1:119348‑M1/18‑300 (MQ=255) tgggtaagatcaGAAATCCATGGATAAGTTAACAACGGGTGTCGCCTATGGCACCTCAGCAGGTAGTGCCGGGTACTGGTTTGTACAGCTGCTAGATAAAGTCACTCCCTCACAGTGGGCAGCAATAGGTGTGCTGGGTAGCCTGGTATTTGGCCTGCTGACGTACCTGACAAACCTTTATTTCAAGATTAAAGAAGATAAGCGCAAGGCTGCGAGAGGTGAATAATGCCTCCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATc > 2:481018‑M1/13‑300 (MQ=255) 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AATTATTTTTTGGTTATTTGTTGAGATTTGCTTATGTATTTGTAGTGGTGTTTTCAATACTCGGTAGCATTCTCTCAAATATCATTTAGTGGTTTACGTACGTAAAAAATTGGTTATGCTGTTAAGAGTGGTTACTTCGTCACACAGCTTAAACCCGCCGTCGAGCGGGTTTTTCCATTTTTTGAGTCTCGATATTAGCTGATAACCCAATACCTGAGTTATTCACTGACTCCGAGTCTGTTACGTTTCGTAGTATTCCCTCAATTTACACCCGCTTTGTCTGCGAGGTGGGGTTATGAAATCCATGGATAAGTTAACAACGGGTGTCGCCTATGGCACCTCAGCAGGTAGTGCCGGGTACTGGTTTTTACAGCTGCTAGATAAAGTCACTCCCTCACAGTGGGCAGCAATAGGTGTGCTGGGTAGCCTGGTATTTGGCCTGCTGACGTACCTGACAAACCTTTATTTCAAGATTAAAGAAGATAAGCGCAAGGCTGCGAGAGGTGAATAATGCCTCCATCATTACGAAAAGCCGTTGCTGCTGCTATTGGTGGCGGAGCAATTGCTATAGCATCAGTGTTAATCACTGGCCCAAGT > NC_000913/577103‑577699 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |