| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 485,359 | IS2 (–) +5 bp | coding (257‑261/1194 nt) | acrA ← | multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrA |
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| * | ? | NC_000913 | = 485363 | 0 (0.000) | 79 (0.800) | 57/598 | 0.4 | 100% | coding (257/1194 nt) | acrA | multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrA |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
GAACAACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTAAACCCCAGAACTTACTTATGCTGATTCCGGTGCGAAAATTGTTAATAAAGGTACTTGTAGATTCAATTGGTCAACGCAACAGTTATGTGAAAACATGGGGTTGCGGAGGTTTTTTGAATGAGACGAACATTTACAGCAGAGGAAAAAGCCTCTGTTTTTGAACTATGGAAGAACGGAACAGGCTTCAGTGAAATAGCGAATATCCTGGGTTCAAAACCCGGAACGATCTTCACTATGTTAAGGGATACTGGCGGCATAAAACCCCATGAGCGTAAGCGGGCTGTAGCTCACCTGACAC > NC_000913/1468945‑1469538 | gAACAACCTGTTCTCTGGCGGCGACAGCAGTAAGACGTCCTTCCTGGTATTGCTGACGCCAGAGAAATAACTGACTGACTGCTACACCATGTTGACGGGCAACTAGGGAGACCGTCAGCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTCTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTGGCTCCGGCCCTAAGACATCAATCAGCTGGTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAATATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCCGGAGATTCATGGGGCCAGTCTAAAcc < 2:393367/300‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |