| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 696504 | 167 (1.680) | 11 (0.120) | 10/540 | 4.4 | 6.6% | noncoding (1/75 nt) | glnX | tRNA‑Gln |
| ? | NC_000913 | 696940 = | 161 (1.800) | intergenic (‑1/+23) | glnU/leuW | tRNA‑Gln/tRNA‑Leu | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
CGGGTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC > NC_000913/696207‑696802 | cGGGTTAATTGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGGTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAc < 1:325714/300‑1 (MQ=255)cGGGTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAc < 1:329209/300‑1 (MQ=255) taattgttgtggAGCGTGCGGGTGTGGTGAAGTGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGTTTGTAGCCTTACAACATCGCCGGATGTGTGCCAGCCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCAGCGCGTCCGATATTGAAGGATAAGACGTGTCAACAGCACAGTCGACATTGAATAAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCCCCGAAACGAGCTTTTTTAATATG‑GCTGGGGTACTAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCaataaccg < 1:19241/290‑7 (MQ=25) tAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGGTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGTGTTGTAGCCTTACAACATTGCTGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATATG‑GCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCaataaccg < 2:45423/300‑7 (MQ=38) gcggcgGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTAACGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTA‑CACt > 2:492124/1‑300 (MQ=255) gcgCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAGCGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTCATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAccgtctgcaggtgcacg > 1:633210/3‑284 (MQ=255) aGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAgg < 1:415364/300‑1 (MQ=255) aGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCGGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAgg < 2:242647/300‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGt > 1:149355/1‑300 (MQ=255) cGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTa < 1:139014/300‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACCAGGTaa > 2:349420/1‑300 (MQ=255) gTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACCGGGTG‑CAATTACAAGGTaa > 1:691493/1‑300 (MQ=255) gtTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCGACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCCTGGCGATACCCCCACCAGGTG‑TACTTACACGGTAAgagcccggcc > 2:411578/1‑291 (MQ=39) gtTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGACGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGCG‑CATTTACAAGGTAGGCGTCTTgga > 2:617369/1‑298 (MQ=255) gAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGGCGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTAACGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CCCTTACAAGGTAGGCGTCtcgcataa > 2:174048/1‑293 (MQ=255) gatgtGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAg < 2:510368/296‑1 (MQ=255) tatGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGa < 1:120430/300‑1 (MQ=255) gCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTc > 1:41911/1‑300 (MQ=255) gggTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCt > 1:703712/1‑300 (MQ=255) gTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAATGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCg > 1:782932/1‑300 (MQ=255) gCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAAACTGGGTG‑CATTTACAAGGTAAGCGCCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGACTGc > 1:183028/1‑300 (MQ=255) ccTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGcc > 2:512940/1‑300 (MQ=255) ccTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGACGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAAGTAAGCGTCTTGAATAAATCGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGcc > 2:790248/1‑300 (MQ=255) ttACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCgg > 1:645944/1‑300 (MQ=255) cAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCg < 1:212117/300‑1 (MQ=255) gaCCGGAGGTCGGATAATACGCGGCAGCGTCGCATCCGACAGTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGAGATACCCCAACTGGGGG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGc < 1:97272/299‑1 (MQ=255) aCCGTAGGGCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCCCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCt < 1:345174/300‑1 (MQ=255) ccGTAGGTCGGATACGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGACAAGGCGTGTCAACATCGAATTCGAAATTGAATGAACGCAGAAAAGCACAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACATCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGTCTTACCGCTTGGCGATACCCAACCTGGATG‑CCCTTACAAGGTCAGCGTCTTGAATAAGTTGGCTGGGGTACGCGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGACTCCGAATCCGGTGCCTTaacgatt > 2:440313/1‑294 (MQ=255) ccGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTTGGTG‑CCCTTACAAAGCCAACATCCCAAACAAACTGGCTGAAGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATCAGAATCAGGTGCCTTACCgatt > 1:614682/1‑297 (MQ=37) ccGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCtt > 1:121968/1‑300 (MQ=255) aCGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTTAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCcaacaa < 1:216593/300‑1 (MQ=255) cgGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTAGGTG‑CACTTACAAGGTCGGCGTCTCGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAAACTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCcaacaaccg > 1:311278/1‑297 (MQ=255) ggATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑TCCTTACACGGTCAGCGTCTCGAATACATTGGCTGGGGTACGCGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGCATCAGAATCCGGTGCATTACCGCTTGGCAATAACCCAACAGAGTGATTTTGACTTTGcagcatatagtc > 2:79425/1‑289 (MQ=37) ggATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAATGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCATTACCGCTTGGCGATACCCCAACCCCTTGGTTTTGAATTTGcagcgcatattc > 2:228924/1‑289 (MQ=39) gATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGCACATATTCg > 2:768924/1‑300 (MQ=255) tAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGAt < 1:165467/300‑1 (MQ=255) cGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAtt > 1:360639/1‑300 (MQ=255) cGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATCAGACTCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACAtt > 1:396543/1‑300 (MQ=255) tgtCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACCGGGTG‑CCCTTACAATGTCAGCGTCTCGCCTATATCTTCTGGAGTCGGCGGCTTCGAATTTCGTCATGCCGGCATCCGCATCCTTTGCCTTACCGCTTGGTGATACCCCAACAAATTGATTTTGAATTTGCCGCACATAGTCGATACATTCa > 1:752666/1‑300 (MQ=21) gtCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCNGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCNTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CCATTCCCCGGTAAACGTCTTGAACAACTCGACTGGGATACGAGGATTCGACCCCAGGAACGCAGAAATCAAAATCCGATACCCTCACGCTCGACGATACACCCATAGGGTGGTTTTGTATTTGCCGCACATATTGGATACAtttag > 2:568790/1‑297 (MQ=16) 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ccccAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAtcttttttttcgcgataccttatcggcgttgcggggcgcattatgcgtatagagcctt > 2:278121‑M1/1‑242 (MQ=255) ccccAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAtcttttttttcgcgataccttatcgacgttgcggggcgcattacgcgtatagagcatt > 1:100197‑M1/1‑242 (MQ=255) ccccAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTCCCTGGATTCGAACCAGGGAATACCGGTATCaaa > 1:504347/1‑300 (MQ=255) ccccAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCaaa > 1:281693/1‑300 (MQ=255) ccccAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGCTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGGGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAtctnttttctcacactaccttatcaacgttgctagaagcattacgcgccgtctcctac > 2:587664‑M1/1‑242 (MQ=255) cAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAc < 1:116651/300‑1 (MQ=255) | CGGGTTAATGGCGGCGGAGCGTGCTGGCGTGTTGAAACGTCAGGCGCTGAAATATGCGTTAGGGTTGTAGCCTTACAACATTGCCGGATGCGTGCCAACCGTAGGTCGGATAAGACGCGGCAGCGTCGCATCCGACATTGAAGGATAAGACGTGTCAACATCGCATTCGACATTGAATGAACGCAGAAAAGCAAAAAGCTCGCCGAAGCGAGCTTTTTTAATGTG‑GCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACTGGGTG‑CACTTACAAGGTAAGCGTCTTGAATAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACAAATTGGTTTTGAATTTGCCGAACATATTCGATACATTCAGAATTTGGTGGCTACGACGGGATTCGAACCTGTGACCCCATCATTATGAGTGATGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAAC > NC_000913/696207‑696802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |