| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 572,138 | IS2 (+) +5 bp | coding (685‑689/798 nt) | ybcM → | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 572138 = | 0 (0.000) | 141 (1.170) | 79/598 | 0.2 | 100% | coding (685/798 nt) | ybcM | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
AACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381551‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGCTCCTGAATTTTAGTTGA < NC_000913/572142‑571844 AACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACTTATAGG < 1:335400/300‑1 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ATTCAGGGGGCCAGTCTACTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACTGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGC < 1:873826/300‑1 ATTCAGGGGGCCAGTCTACTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGC < 1:774254/300‑1 TCAGGGGGCCAGTCTACTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGCTC > 1:119856/1‑300 GGCCAGTCTACTTATAGTTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGTAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATTTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCGAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGCTCCGGAAT < 1:39380/300‑1 GGCCAGTCTACTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGCTCCTGAAT > 1:950966/1‑300 ACTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGACCATTGCTAAGTGCTGCTGAATTTTAGTTGA > 2:441932/1‑300 AACCTGTTCTCCGGCGGCGACAGCAGTAAGACTTCCTTCCTGGTATTGCTTACGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/381551‑381260‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTATAGGTTTTACCGTCGTTTGTATAGCAGACAACGCATTATTTAACCTCACATCGTCCAGTATACTTTGGAAACTTACCCCCTCGCTTGCTAGACGGCGATGTAATGTAGAAACAGAAATGTAGAGATATCGAGCAACCTTGTTTGCTGTCCATTTTGTGCCGGGTTCGGATAGCAGCAGGTTATAACAACGACTTATCAATGATTGTTTACTATATGATAAAAGTAAATGATTAACATGATTCACTCCTAACGAAAGTAGAACGCCCATTGCTAAGTGCTCCTGAATTTTAGTTGA < NC_000913/572142‑571844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |