| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 186,117 | 0 | G | A | 70.0% | 195.9 / 94.7 | 111 | A845V (GCC→GTC) | glnD | protein‑PII uridylyltransferase/uridylyl‑removing enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/18); new base A (36/41); total (52/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
GTGCGCCGGAATCCAGCAGGGCGATCACCTGATTTACCGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTATCC > NC_000913/185821‑186404 | gggcgcCGGAAGCCAGCAGGGCGATCACCTGATTTACCGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGacac < 1:520599/298‑1 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cttctACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGACACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGANTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAANGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGtt > 2:578484/1‑300 (MQ=255) cAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTNTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCNGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAgg < 2:580380/300‑1 (MQ=255) cAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGGCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCAGGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAgg < 1:261638/300‑1 (MQ=255) cAATGGTTGTAATTCGGACACCATGAAGCGAAATTCCCAGCTCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAgg < 2:720863/300‑1 (MQ=255) cAATGGTTGTAATTCGGACACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAgg < 2:437006/300‑1 (MQ=255) gTTGTAATTCGGACACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCAATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGCTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTATcc < 2:252932/300‑1 (MQ=255) | GTGCGCCGGAATCCAGCAGGGCGATCACCTGATTTACCGCTTCGCGGGTAACGGTGTCTGCATTGGCTGGCGTGATCTCGGCACGGCGTTCAAAAGCGGTTTCAATAATGTTCTGTAACTGCTGCATTGTTAAACTCTTTTCATATCAGTAAACACATCACCCTTTATCGTTTGGATTGAGGGCCTCTGTCAACCGCTGATGCACTTCCTGCTGCAACTCGTTATTAAGCGCACGCCGGTCAGCGGTGGCAATTATGAATAAATCTTCTACTCGCTCGCCAATGGTTGTAATTCGGGCACCATGAAGCGAAATTCCCAGATCGGCAAAAATTTTCCCGACTCGCGCCAGCAGTCCAGGTTGGTCGAGGGCGATCAGTTCGAGGAACGATTTGCGGTCGGTATGGGTCGGCAAAAACGTTACTTCGGTTTCAACAGTAAAATGGCGTAATTTGGCGGGTTGGCGACGGGGCTGCGGTGGCTGCCAGCTACTTTGCGTCAGTACTTGCTCCAGACCAAACCGAATAACCTCATGACGATCTGCGGACAGCGGGTTGCCATCGGGTTCCAGCACGATAAAGGTATCC > NC_000913/185821‑186404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |